定量内参基因Ct相差较大
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/17 01:42:45
直接在NCBI里面查找金银花的内参基因,如果没有的话,就找与金银花同种属植物的内参基因.我做过猪的,在NCBI里查不到猪的内参基因,我就用的小鼠的,因为是持家基因,所以在哺乳动物里面表达的差异不大,也
看看你的GAPDH引物Tm多少,有可能是因为PCR条件适合目的基因引物对而不适合内参引物对吗?再问:不知道,我是个新手什么都不懂再答:那么童鞋,你还是找一个师兄师姐前辈高人带一下。网上这样问很难问出来
相对定量有两种方法.要求扩增效率相同的是ΔΔCt法,因为只有扩增效率相同目的基因与内参基因的Ct值之差才是恒定的值,这是使用这种方法处理数据的前提,所以正式实验之前要进行条件优化,这种方法的优势是不用
朋友,首先跟你说一下我的经验,其实这里有个误区,其实普通PCR对RealtimePCR的指导意义实在是太小,因为realtimePCR的引物跟普通PCR的引物有很大差别,realtimePCR的引物因
可以.定量PCR内参的选择最重要的是这个基因在不同个体之间的此组织(比如是肌肉)表达恒定.所以你需要找好了.
这要看你内参照的意思是什么了,如果是防止假阴结果,比如PCR体系受抑制之类的,如果有内参就知道这个结果是被抑制了还是真阴性结果,这时内参探针设计非常简单,就是将目标探针中间几个点突变一下,内参引物和靶
这个要看你在做PCR前的加样量是否一致.如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题.理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样.如果你能肯定加样
1,首先需要根据三个目标基因及Actin的序列设计四对引物,引物设计原则同普通PCR引物,网上有很多介绍的,最好其中一个引物是结构基因部分序列+内含子部分序列这种模式.序列长一些25++,退火温度高一
内参就是一个表达量在各个组基本保持不变的基因,又叫看家基因,比如常用的GAPDH,actin.或者18srRNA也可以.如果内参表达量一致,说明你PCR的上样量一致,样本的质量也一致.如果出入很大,说
理论上是越一致越好.如果有很大的差异,说明实验有较大的误差,或者样本有降解.
问题有可能如下:1)模板制备有问题.你可以用普通PCR扩增,然后电泳确定是不是模板有问题?2)引物问题:引物设计的好与否,对Realtime结果至关重要!可以用普通PCR确定你的引物扩增效率如何?模板
1.6-kbfragmentencompassingtherp49gene,whichcodesforaribosomalprotein,hasbeenclonedandsequencedinDros
没有关系,可以继续按正常步骤计算.内参的CT值通常要控制在25-30,目的基因CT值高,只说明目的基因表达量比较低..没关系..
那是内参引物可能有问题,建议重新设计内参引物
因为内参和目标基因的扩增效率有可能不一样,所以CT值不能直接相减.只能是内参间先算出相对量,目的基因也算出相对量(倍数),然后在用目的基因的倍数除以内参的倍数.再问:一共有三个内参基因,他们的几何平均
啥叫不同阶段只要模板不同就要检测内参标准曲线是指拿已知浓度的标准品做出来的曲线不是一个概念
这个概念一般是用在定量PCR中.定量PCR是要检测某个基因的表达,降低或者提高,但是当你得出结果以后,你并不知道是它本身的表达降低/提高了,还是你操作过程中造成的误差(比如提RNA时的损失),所以这个
用内参的方式进行realtime定量是不需要考虑加样量和反转录效率的问题的,因为结果都是和内参比,和内参同多同少.realtime不准是很常见的事,rna降解、引物特异性差、模板太浓或太稀等等许多因素
不同基因之间表达量差异很大,可达上千甚至上万倍之差,所以CT值差10以内属正常现象,但通常选用内参基因属于表达量较高的持家基因,如果目标基因和内存基因表达量(CT值差)过大,用内参基因来衡量目标基因的
2-ΔΔCt法.定量的作用是比较两个或多个样本(前提是细胞数目要相等)基因表达量差异的,基因拷贝数/内参拷贝数只是一个样本的相对定量值.内参的作用只是消除样本间细胞数目的差异.