作业帮请略解释下数字表达谱（DGE）相比于基因表达谱芯片的区别?优势?
来源：学生作业帮 编辑：作业帮 分类：生物作业 时间：2024/05/21 20:52:39
请略解释下数字表达谱（DGE）相比于基因表达谱芯片的区别?优势?
如果可以的话,稍微讲解下两个的基本原理.
我不是很懂，我的基本理解是：
芯片：就是对已知的基因去在case与control组之间做杂交，以分析表达差异？（好像这个不涉及到转录组测序吧，无非就是和探针的杂交，与southern\northern 类似？）
而DGE的话：是对某一状态的所有转录本进行测序，无所谓什么已知或未知的基因。（话说测序怎么看丰度，测序不只是能测到序列而已嘛？呵呵）。
如果可以的话,稍微讲解下两个的基本原理.
我不是很懂，我的基本理解是：
芯片：就是对已知的基因去在case与control组之间做杂交，以分析表达差异？（好像这个不涉及到转录组测序吧，无非就是和探针的杂交，与southern\northern 类似？）
而DGE的话：是对某一状态的所有转录本进行测序，无所谓什么已知或未知的基因。（话说测序怎么看丰度，测序不只是能测到序列而已嘛？呵呵）。
最大的区别是：芯片上的探针都是固定已知的.只是用不同样本的RNA杂交然后比较差异的表达谱,芯片跟测序是两个概念,原理就是杂交.
DGE测序可以得到某一状态下的所有转录本的表达谱,比芯片覆盖的范围要大.目前的测序前的建库都有个PCR扩增步骤,所以会有个信号放大的过程,一个序列被测到一次这个基因的丰度就是1,测到100次丰度就是100,因此每个基因的丰度是不同的.DGE也即是说把基因的表达谱用数字化直观的表示出来.你可以再了解了解~
DGE测序可以得到某一状态下的所有转录本的表达谱,比芯片覆盖的范围要大.目前的测序前的建库都有个PCR扩增步骤,所以会有个信号放大的过程,一个序列被测到一次这个基因的丰度就是1,测到100次丰度就是100,因此每个基因的丰度是不同的.DGE也即是说把基因的表达谱用数字化直观的表示出来.你可以再了解了解~