PCR扩增时,引物与模板配对到什么程度就可以扩出目标片断?不考虑其他因素.请给详细专业的回答
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:语文作业 时间:2024/05/11 19:39:55
PCR扩增时,引物与模板配对到什么程度就可以扩出目标片断?不考虑其他因素.请给详细专业的回答
我的意思,是不是引物比如说25bp ,要与模板完全配对才可以扩增,还是可以有一个或几个不匹配的也可以扩得到(不要考虑温度和试剂等方面,只单纯从引物与模板相配方面讲).另外,如果差一点也可以扩增出来,那差别多少后就扩不出来了?
我的意思,是不是引物比如说25bp ,要与模板完全配对才可以扩增,还是可以有一个或几个不匹配的也可以扩得到(不要考虑温度和试剂等方面,只单纯从引物与模板相配方面讲).另外,如果差一点也可以扩增出来,那差别多少后就扩不出来了?
这取决与你使用的退火温度,引物浓度,离子强度,引物序列等诸多问题
3‘端5个碱基影响扩增效率,当这5个中特别是后3个中有错配特别影响引物扩增的效率,但并不是不能引发,比如ssp引物配合taq酶,当退火温度降低时,即使3’端碱基不互补也能发生扩增.简单的说一个碱基错配会降低引物tm3-5度,当tm严重低于退火温度时便不能引发扩增,所以差多少能扩出来取决于错配碱基的位置,引物长度和tm,退火温度.5’端的修饰,如引入突变或加入酶切位点,这些序列是不计算在引物tm中的,不需要考虑,只要在3‘端有能提供足够tm的序列即可.
3‘端5个碱基影响扩增效率,当这5个中特别是后3个中有错配特别影响引物扩增的效率,但并不是不能引发,比如ssp引物配合taq酶,当退火温度降低时,即使3’端碱基不互补也能发生扩增.简单的说一个碱基错配会降低引物tm3-5度,当tm严重低于退火温度时便不能引发扩增,所以差多少能扩出来取决于错配碱基的位置,引物长度和tm,退火温度.5’端的修饰,如引入突变或加入酶切位点,这些序列是不计算在引物tm中的,不需要考虑,只要在3‘端有能提供足够tm的序列即可.
PCR扩增时,引物与模板配对到什么程度就可以扩出目标片断?不考虑其他因素.请给详细专业的回答
PCR引物的问题PCR时,单引物可以扩增模板吗?
PCR扩增目标基因,完全没有条带.是不是设计的引物太短?引物只有10个碱基和模板配对
设计引物扩增模板基因,引物中至少要有多少个碱基与模板配对?16个可以吗
引物是否只是PCR扩增中的目标链,它与扩增产生的DNA链序列有什么区别?
谁能通俗易懂的给我解释一下PCR反应过程中,引物与模板如何结合?扩增出来的是上下游引物之间的片段呢?
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PCR扩增时引物的位置
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PCR扩增时为什么需要引物呢?