作业帮您好,我想问一下实时荧光定量pcr的数据分析!
来源：学生作业帮 编辑：作业帮 分类：生物作业 时间：2024/05/21 12:30:18
您好,我想问一下实时荧光定量pcr的数据分析!
我有普通组,实验组1,实验组2,三个组,既要检测这三个组中每个组不同部位之间是否有差异,也要比较这三组中同一部位之间是否有差异,用2-△△ ct法算的话,应如何算?对于每组不同部位的比较的话,将其中一个处理为1进行比较吗?那对于三个组中的同一部位的比较的话,难道也要将其中一组处理为1吗?我不太清楚,看文献也没怎么看懂,希望大侠不吝赐教,
我有普通组,实验组1,实验组2,三个组,既要检测这三个组中每个组不同部位之间是否有差异,也要比较这三组中同一部位之间是否有差异,用2-△△ ct法算的话,应如何算?对于每组不同部位的比较的话,将其中一个处理为1进行比较吗?那对于三个组中的同一部位的比较的话,难道也要将其中一组处理为1吗?我不太清楚,看文献也没怎么看懂,希望大侠不吝赐教,
用2-△△ ct法算的话,应如何算?
假设检测A基因,CT分别为（这里记住CT越大,表明相对含量越低）
普通组/Test1：28
实验组1/Test2：29
实验组2/Test3：30
这时候要设对照了,假设Test1为对照组（普通组）,当然是以普通组为对照
那么,相对含量为：
普通组/Test1：1
实验组1/Test2：2^-(28-29)=1/2=0.5
实验组2/Test3：2^-(28-30)=1/4=0.25
A基因在实验组1和实验组2中的表达量,分别下降2倍和4倍!
所以,就出来啦,结果
对于每组不同部位的比较的话,将其中一个处理为1进行比较吗?
如
实验组1
Testis
Brain
Liver
Muscle
可以把任何一个作为1,作为对照,但是要在figure 的legend中注明出来,说清楚就好了!
那对于三个组中的同一部位的比较的话,难道也要将其中一组处理为1吗?
是的,可以,如
Brain
普通组/Test1
实验组1/Test2
实验组2/Test3
就以普通组/Test1,为对照组,设为1,其他为相对含量,也要在figure 的legend中注明出来说清楚!
再问： 可不可以不管组内还是组间，将其中一个处理为1，就拿我的这个实验而言，普通组是没有,加任何东西的，实验组1加了A物质，实验组2加了B物质，看心，肝，脾，肺，肾这5个组织的表达差异，我将普通组的心处理为1（即△△ ct=0），剩下的部位在算△△ ct时，都用各自算出的△ ct值减去普通组心的△ ct值，算出2-△△ ct，再用来统计分析看同一组中5个部位表达如何以及同一部位不同组表达如何？谢谢您
再答：
可以啊，结果就是这个样子的！！！You set the mRNA expression of gene X in heart as control!
假设检测A基因,CT分别为（这里记住CT越大,表明相对含量越低）
普通组/Test1：28
实验组1/Test2：29
实验组2/Test3：30
这时候要设对照了,假设Test1为对照组（普通组）,当然是以普通组为对照
那么,相对含量为：
普通组/Test1：1
实验组1/Test2：2^-(28-29)=1/2=0.5
实验组2/Test3：2^-(28-30)=1/4=0.25
A基因在实验组1和实验组2中的表达量,分别下降2倍和4倍!
所以,就出来啦,结果
对于每组不同部位的比较的话,将其中一个处理为1进行比较吗?
如
实验组1
Testis
Brain
Liver
Muscle
可以把任何一个作为1,作为对照,但是要在figure 的legend中注明出来,说清楚就好了!
那对于三个组中的同一部位的比较的话,难道也要将其中一组处理为1吗?
是的,可以,如
Brain
普通组/Test1
实验组1/Test2
实验组2/Test3
就以普通组/Test1,为对照组,设为1,其他为相对含量,也要在figure 的legend中注明出来说清楚!
再问： 可不可以不管组内还是组间，将其中一个处理为1，就拿我的这个实验而言，普通组是没有,加任何东西的，实验组1加了A物质，实验组2加了B物质，看心，肝，脾，肺，肾这5个组织的表达差异，我将普通组的心处理为1（即△△ ct=0），剩下的部位在算△△ ct时，都用各自算出的△ ct值减去普通组心的△ ct值，算出2-△△ ct，再用来统计分析看同一组中5个部位表达如何以及同一部位不同组表达如何？谢谢您
再答：
可以啊，结果就是这个样子的！！！You set the mRNA expression of gene X in heart as control!