PCR引物设计中,引物上是否需要每个碱基都与模板链结合?

来源：学生作业帮编辑：作业帮分类：综合作业时间：2024/05/22 10:06:43

PCR引物设计中,引物上是否需要每个碱基都与模板链结合?
为了得到想要的Tm值,或是保证长度,不产生二聚体等,可不可以有在引物上添加一些不配对的碱基?
如下图：

可以的话,会对扩增有影响么?
如果不可以,为什么?

可以在引物上添加不配对的碱基,但是在引物的3‘端,至少有三个碱基是严格配对的.但是这样的操作主要是为了添加酶切位点或者flag等.
Tm值是根据两条链的退火情况来计算,不配对的碱基不算在内,所以你添加不配对的碱基对于Tm值几乎没有影响.
保证长度--没有必要添加不配对的碱基.
不产生二聚体--也没有必要,引物自身的碱基配对对于扩增影响不大,引物间的二聚体可以根据引物位置的选择来避免,无法避免时要保证3’端无配对.
所以不建议添加不必要的碱基来设计引物.（某些干扰实验除外）

PCR引物设计中,引物上是否需要每个碱基都与模板链结合? 设计引物扩增模板基因,引物中至少要有多少个碱基与模板配对?16个可以吗 PCR中引物如何设计, 谁能通俗易懂的给我解释一下PCR反应过程中,引物与模板如何结合?扩增出来的是上下游引物之间的片段呢? 怎么样设计pcr引物 pcr引物怎么设计 PCR引物设计 PCR扩增目标基因,完全没有条带.是不是设计的引物太短?引物只有10个碱基和模板配对不知序列的DNA模板PCR引物的设计关于PCR PCR技术中,引物是不是可以与模板DNA单链的一端,而非顶端结合呢?要是引物所有的碱基对与模板链碱基对都结合 pcr扩增中,如何设计引物? 请问在PCR实验中,如果不知道模板DNA的核酸序列的情况下如何设计PCR引物?