扩增整个基因序列怎么设计引物

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/17 07:33:26
如何读基因序列,设计引物时的保守区指那一段序列

从NCBI中下载基因的序列,再用DNASTAR进行比对,那是保守区域!

使用PCR扩增以下DNA模版中的基因1,需要的一对引物序列是

正向引物:5'CTTCGAAATTC反向引物:5'CCGATCGGGAGA(TCTCCCGATCGG的反向互补序列)当然,这对引物有些短,其实真正设计时上下游引物的序列中都可包含部分基因1的序列,以平

microRNA的茎环引物及其PCR扩增的上游引物怎么设计?

合成的单链在实验时又一个和模板结合的退火过程,在这个过程中会自动形成茎环结构,如果你的茎环结构设计合理的话.我也在类似文献上看到过上游引物含有额外的碱基,上面有说明的,是为了调整Tm值.上游引物不能全

已知到某一基因的部分序列想要设计引物继续扩序列,选取哪一块设计引物

你先设计几条引物,然后上NCBI数据库BLAST一下(在外显子上设计比较好些)再问:我的想法是先将已知的序列与同源物种比对,以同源物种多出的区域设计上下游引物,可是这样得到的引物分值太低,怎么办再答:

知道引物序列怎么推算扩增片段

用primerblast,输进去上下游,选好种属和扩增对象search不就出来了

scleraxis的基因序列 设计引物

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/194473617?report=genbank

PCR扩增时,序列AT含量太高如何设计引物?

试试吧.退火温度低一些50左右

如果要使用PCR扩增一段已知的DNA序列,要如何设计引物

把这段基因输入设计软件里,调节引物位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-(5到10度)延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物.如果你要扩增整个的基因

给出dna序列怎么设计引物

这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.

以真核基因mRNA设计引物扩增出的是什么?是DNA还是mRNA?

cDNA再问:真核基因转染其他细胞时一般选择表达DNA还是mRNA?再答:转进去的是DNA。整合到受体基因,表达mRNA再问:那你研究某一基因时,若需克隆你是不是一般以DNA序列设计引物啊?若是以mR

引物设计问题,以mRNA序列设计引物,然后用cDNA为模板来扩增,在设计引物时mRNA序列是否要反转序列?

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.

已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?

首先请上NCBIBLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.若搜索不到任何信息,就需要通过设

我想问根据同一个基因设计的两个引物,都在小麦中扩增,扩增片段大小是否一样?

如果这两个引物特异性很好,扩出来的不是非特异性片段,那么大小应该是一样的,只不过若有等位基因存在的话,会出现个别碱基缺失,也就是会有几b的差异.

已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?从5'端or3‘端

首先请上NCBIBLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.若搜索不到任何信息,就需要通过设

根据某一基因mRNA序列设计的引物,可以用来从个体提取全基因组中DNA中扩增该基因么?

根据mRNA(真核的)设计的引物,一般如果用DNA做模板的话,那么会出现的情况会是以下几种.一是能扩增出条带,但目标条带比你要的条带要大,因为你会连同内含子一同扩增出来,所以片段会偏大.二是什么都扩增

测序结果怎么找不到我的扩增引物序列?

对于这种情况,如果你只是找不到扩增引物的序列,但是能找到后面所要扩增的序列的话,那么可能还是因为测序引物离你的扩增片断太近.如果不是这种情况,那么可能是你根本没有将扩增片断成功连入当然还有一种可能是公

PCR引物设计中的问题、保守序列在目的基因内、但是引物为什么在保守序列设计?

一般对于已知序列的PCR当然不要从保守序列来设计引物,只要从开放可读框前后开始设计就行了.需要从保守序列设计引物的情况一般是两种,一是某个物种里面某个特定基因序列从未被分离过,但其进化关系相近的物种有

为什么PCR引物设计中引物可以不从扩增序列两头开始?不从两头开始能得到上下游引物以外的序列吗?

这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握

各位高手请问一下Burkholderia菌是属于细菌,我可以用3'RACE方法扩增其全基因序列吗?引物怎么设计

这个比较麻烦,如果你想用RACE的方法,3'末端需要添加上像真核生物那样的polyA尾巴,而且你要克隆它的全基因序列,还要做5'RACE.RACE技术比较适合真核生物.如果你要克隆的基