根据某一基因mRNA序列设计的引物,可以用来从个体提取全基因组中DNA中扩增该基因么?
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:生物作业 时间:2024/05/10 11:40:12
根据某一基因mRNA序列设计的引物,可以用来从个体提取全基因组中DNA中扩增该基因么?
我们知道mRNA是经过其前体剪接后形成的成熟RNA,那么根据它设计的引物,有无可能跟其原始的DNA不配对呢,然后导致不扩增呢?
谢谢,可是我说的是用根据mRNA设计引物,然后用DNA模版中扩增!
我们知道mRNA是经过其前体剪接后形成的成熟RNA,那么根据它设计的引物,有无可能跟其原始的DNA不配对呢,然后导致不扩增呢?
谢谢,可是我说的是用根据mRNA设计引物,然后用DNA模版中扩增!
根据mRNA(真核的)设计的引物,一般如果用DNA做模板的话,那么会出现的情况会是以下几种.一是能扩增出条带,但目标条带比你要的条带要大,因为你会连同内含子一同扩增出来,所以片段会偏大.二是什么都扩增不出来,这种情况一般是两种原因,1个是内含子片段太大,taq聚合酶没有延伸完,这种情况是很常见的,真核生物的基因组DNA编码序列中的内含子一般都很大.还有一种原因是你设计的引物正好是跨了内含子的序列,也就是说你的引物序列设计的时候位于两个外显子之间,这样的情况是扩增不出东西的.不过这种情况很少,因为一般设计的引物长度约20bp,而且位于序列的最两边,在最两边的这么少数碱基中出现内含子的可能性很小.最后一种情况是扩增出正好和你目标序列差不多的片段,原因是基因组DNA中有一些序列是没有内含子的,典型的就是线粒体和叶绿体DNA,这些DNA更接近于原核生物,编码的基因是没有内含子的.
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已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?从5'端or3‘端
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