扩增基因时设计引物要注意什么
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/16 17:09:18
只能两头设计你不知道基因名字么实在不行拿序列去BLAST上比对下也能知道它前后是啥啦
如果只想做序列的克隆,那么引物往两端延伸没问题.如果要做蛋白表达的话起始端必须是起始密码子.引物不可以在起始密码子之前,否则影响表达起始.扩不出来的话,首先分析一下序列,是否GC含量较高.然后尝试一下
引物的功能是作为核苷酸聚合的起始点,引导DNA的合成.能设定循环次数,及控制复制次数.PCR循环次数主要取决于模板DNA的浓度.一般的循环次数选在30~40次之间,循环次数越多,非特异性产物的量亦随之
当然可以咯,不过我没明白为什么上游引物GCrich跟分两段扩增有什么关系,1.2K一次扩增是完全没有问题的,如果上游引物出现GCrich的情况,那么可以考虑在更加上游的地方设计引物啊,在这个基因外测的
ATCG.原理就是体外环境模仿人体内环境,完成人体内的DNA复制,大概就这样.
一定要的.正向引物:5'.CTTCGAAATTC3'反向引物:5'.CCGATCGGGAGA3'回答楼主的补充问题:设计正向引物时,该引物序列应该具有和你待扩增DNA序列接近5‘段处的序列.反向引物设
若是根据已知序列扩增未知物种的相应序列,可以根据先根据已知序列进行Blast搜索,发现其他同源序列,保存后进行比对,找出其中较保守区域,并根据Primer或Oligo等软件对某条序列进行分析,搜索其中
组蛋白基因(histonegene)组蛋白基因在各种生物体内重复的次数不一样,但都在中度重复的范围内.通常每种组蛋白的基因在同一种生物中拷贝数是相同的.鸡的基因组中组蛋白基因有10个拷贝,在哺乳动物中
这一步骤是将目的DNA片段构建到某载体(质粒)上,并转化大肠杆菌保存.当然最有可能的就是基因克隆.引物可以理解为PCR的指针,确定需要扩增的片段,通过PCR即可扩增出正反向引物之间的DNA片段.
cDNA再问:真核基因转染其他细胞时一般选择表达DNA还是mRNA?再答:转进去的是DNA。整合到受体基因,表达mRNA再问:那你研究某一基因时,若需克隆你是不是一般以DNA序列设计引物啊?若是以mR
cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.
首先请上NCBIBLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.若搜索不到任何信息,就需要通过设
如果这两个引物特异性很好,扩出来的不是非特异性片段,那么大小应该是一样的,只不过若有等位基因存在的话,会出现个别碱基缺失,也就是会有几b的差异.
首先请上NCBIBLAST搜索之(blastp).或许可以直接查到你研究物种的基因序列.即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物.若搜索不到任何信息,就需要通过设
引物长度和专一性常见的引物长度为18-30个碱基.短的引物(≤15碱基)能非常高效地结合,但是它们的专一性不够.较长的引物能提高专一性,然而退火效率低,从而导致PCR产量低下.同时应避免编码单一序列和
为什么只有10个碱基配对呢?引物总长多少?再问:加上3bp保护碱基和9bp酶切位点。总长19bp再答:晕死,这么短,一般引物都是18-20bp,再加上保护碱基和酶切位点好吧再问:好吧。谢谢你啊!又合成
16个退火温度太低了吧18-20不错再问:我需要使退火温度低点。16个会导致非特异性扩增吗再答:会不会有非特异性扩增得去blast一下才知道不过肯定是越短概率越大就是
2758长的片段对引物没有啥特别的要求,25个bp以上的就行.关键是聚合酶的选择,要选保真性好的能过扩增长片段的酶.
“同一对引物可以扩增出不同基因;不同引物也可以扩增出相同基因?”“在基因诊断时,比如镰状细胞贫血是点突变,患者和正常人在突变点两侧的基因是一样的” 这里混淆了基因和基因序列的概念.患者和正常人的基因