怎么用NCBI查找目的蛋白是同源性蛋白

直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC（google之）,和基因组相关的这个网站做的不错

NCBI要好好学啊先用Google翻译成细胞色素c为CytochromeC在NCBI下列表中选择gene后面填上CytochromeCyeast(酵母的血红蛋白意思,别把中文放上去了哈)有COX9、C

1、打开NCBI的主页2、在Search后面的第一个框内选择Nucledite3、在第二个框内输入你所要寻找的菌株名称4、点击Go5、在结果中过滤你需要的基因6、打开该搜索结果即可在最底部看到基因序列

要确定一个ORF,我个人觉得需要确定上游是否有可能的启动子序列先分析启动子可能位置,再确定ORF.你可以把你克隆的片段上游2k以内的序列,用一些启动子分析软件找下,分析下可能的转录起始位点,再在下游找

搜到的序列有些是包含基因所在的染色体片段的,所以很长；有些是该基因的全长序列,包括基因的编码区和非编码区；cds的就是基因的编码区序列.主要看你的目的来选择的.

你这是mRNA序列还是cDNA序列啊?你目的是什么?引物你设计在什么位置,你还是说清楚点吧!再问：要做的是基因的表达，这个基因是从NCBI上直接查询得到的。http://www.ncbi.nlm.ni

进入NCBI主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在第一个下拉菜单Search那一栏中选上gene然后在搜索框中填上基因的名称,还可以加上种属名,如人是Homosapiens以上

在genbank中搜索cytochromeCmRNA,应该可以,不过最好再多几个关键词,比如哪个物种

访问号：NM_001127660.1——变体1TranscriptVariant1:Thisvariant(1)representsthelongertranscript.NM_014874.3——变

举个例子吧.搜索GI号为386311839的蛋白质进入NCBI主页,选择Protein数据库,输入GI号,点击search然后就OK了.

那个检索页上应该会附有参考文献的,你去下载看看就知道了.一般看摘要就可以知道是什么功能.如果没有参考文献,你就去NCBI上的pubmed中检索这个蛋白,可以找到类似的文献就可以知道其功能了.具体工作还

把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦

BLAST是要你输入序列才可以进行的,你输入的是DNA序列,就BLAST基因了,你输入的是氨基酸残基序列,就BLAST蛋白质了

先搜到目的基因,然后display里面选genbank里面会给基因编号完全说明的最下面还会有mRNA和蛋白编号

查mRNA的话,在NCBI主页上AllDatabases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧TopO

+号表示的是相似性质的氨基酸残基.

KEGG网站更容易,输入基因名,点击othorloggenes查看下拉框即可再问：不行没查到可能是我也不会操作吧再答：1、NCBI选择nucleotide,输入基因名，获得该基因某物种的序列。如果已经

从标签之前的启动子算起,直接算到pet-28a上的终止子为止.计算分子量的方法：三个碱基对应一个蛋白质,每个蛋白质的分子量平均为110Da.我认为你的目的蛋白的分子量很可能是380/3*0.11+3=

Google!

在NCBI中需要选核算那个选项,然后写出微生物英文缩写名称,另外最好写上该基因片段名称.点击搜索即可.会搜到很多基因,找几个典型的基因,然后复制到txt文档里,用DNAStar的editseq来查询已