为什么NCBI上给出的cDNA序列是单链
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/15 08:51:17
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
ncbi上面有那个具体的网页很容易找的你确定改片段的名称以及物种就可以
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
进入NCBI主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在第一个下拉菜单Search那一栏中选上gene然后在搜索框中填上基因的名称,还可以加上种属名,如人是Homosapiens以上
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
动物和植物也有同源性嘛,都是由单细胞生物进化来的,拥有共同的祖先.你这段DNA片段是什么基因的?
进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链
PCR必须有模板. 通过RT-PCR获得胰岛素cDNA很麻烦,因为表达胰岛素mRNA的组织或细胞非常局限.你要么需要找到人的B细胞系(这个细胞系不好要也不好养),要么需要联系医院获得人的胰腺组织.这
我预测蛋白质结构域都是在smart上预测的,是个在线的网站,基本还是蛮准的,另外还有许多网站提供在线预测,不过我只用过smart
因为NCBI是按模板链给的,毕竟基因间的比对用得较多,改成U太麻烦,你自己知道mRNA中T应该是U就好了
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
博凌科为-为你回答之前,提醒你注意一个问题,那就是先要搞清楚gene的大致概念.一般而言,一个完整gene是有起始密码子和终止密码信息的,还有各种已知的其他预示结构,所以1.不管哪个序列,你能找到起始
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
提取该物质总RNA做反转录获得cDNA后合成双链根据同源物种的该基因序列设计引物(简并引物)PCR扩增得到目的片段(可能会用到巢式PCR增加特异性)切胶回收纯化质粒载体连接转染筛选获得重组子测序得基因
ncbi序列既有cDNA序列也有mRNA序列,一般会有注释的.如果已经说明是mRNA就不可能是cDNA.mRNA是以正义链的形式给出的,所以是T而不是U.这可能是因为序列提交者一般只对DNA测序,而很
如果你在NCBI查到一个基因,在summary栏目的下面紧接着就是一个叫做“Genomicregions,transcripts,andproducts”的栏目,是一个图,左侧有蓝色的小字“NM_……
序列标签位点sequence-taggedsite,是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间.任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用
第二条结果.查找方式:选择GenomeProject,查找arabidopsisthaliana
cDNA文库是用mRNA逆转录得到的DNA,只含有编辑对应蛋白质的信息,没有控制该基因表达的相关元件(启动子、终止子、增强子),也没有内含子.因此,cDNA文库的基因没有启动子和终止子.