关于一段NCBI上没有的基因序列

来源：学生作业帮编辑：作业帮分类：生物作业时间：2024/05/18 13:09:08

关于一段NCBI上没有的基因序列
该基因在NCBI上没有登录,但是同目物种的该基因有.
通过基因的电子克隆未果.
通过同目物种的该基因的同源性分析,用同源性高的序列与该物种的EST库进行比较,无结果.
如果我现在想要克隆出该基因应该怎么办?

提取该物质总RNA做反转录
获得cDNA后合成双链
根据同源物种的该基因序列设计引物（简并引物）
PCR扩增得到目的片段（可能会用到巢式PCR增加特异性）
切胶回收纯化
质粒载体连接转染
筛选获得重组子测序
得基因序列后根据此序列再次设计引物
做3’和5’RACE
再次测序确认得到全长基因
利用拟南芥突变体做该基因的功能分析
这是我一同学做的博士论文实验过程
做的是某一树种的基因同源克隆

关于一段NCBI上没有的基因序列如何在NCBI上查找某个基因的序列? 如何在NCBI上查找自己需要的基因序列 OMPA的基因序列是什么?怎么在NCBI上查? 氨基酸序列分析,ncbi上哪里可以分析一段基因序列哪一段是内含子? 怎样从NCBI上查载体基因序列,如果NCBI上没有的话要到哪查?例如：pROK II 关于DNA序列在NCBI上比对的问题如何在NCBI上查基因序列看到马上给分比如查乙肝抗体的基因序列有没有知道怎么用NCBI查基因序列, 检测到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不同源的,请问怎么样分析一段基因序列中的内含子,外显子,启动子.在ncbi上找到的外显子后,内含子不符合GT-AG规则怎样在ncbi上查不同品种猪的同一基因的序列呢?