作业帮测抑制剂IC50,酶浓度怎么确定
来源：学生作业帮 编辑：作业帮 分类：综合作业 时间：2024/05/20 04:50:05
测抑制剂IC50,酶浓度怎么确定
好多年前学过生化,全忘了,现在要做一个酶抑制剂得IC50
我想知道IC50是不是应该随着酶浓度得变化有所不同,酶浓度应该怎么确定.如果文献上有该化合物得ic50,是不是必须完全按照他得条件才能重复出来
好多年前学过生化,全忘了,现在要做一个酶抑制剂得IC50
我想知道IC50是不是应该随着酶浓度得变化有所不同,酶浓度应该怎么确定.如果文献上有该化合物得ic50,是不是必须完全按照他得条件才能重复出来
如果只是IC50,一个底物浓度就够了.但是IC50会随底物浓度的变化而变化,所以你要指定一个底物的浓度,发表IC50的时候要注明你底物的浓度.这个浓度如果没有任何依据的随意指定一个,感觉上就会不专业.如果你已经有其它人关于这个酶和其它抑制剂的资料(并且上面详细注明了所用的酶和底物的浓度,还有对底物的Km),你当然可以省事的在其它人的底物浓度下测你的IC50.不过如果你没有详细的相关资料或者不很肯定查到的相关数据,最好是先自己做一下这个酶的动力学曲线.具体怎么做动力学找本书上就有了.简单的就是根据相关资料(新的酶就要看自己的感觉了)设计几个底物浓度,然后调整加的酶的浓度使得所有速度曲线在引发后的几分钟都是线性的,而且前几分钟消耗的底物量一定不要超过底物总浓度的10％.底物的浓度你要高高低低地试几次,然后估算出Km的大致值(加许多底物让酶饱和,这个时候测出的速度应该是Vmax,Km就是使得速度为Vmax一半的时候的底物浓度).然后你设计10～15个底物浓度点上及5倍Km,下及1/5Km,注意Km附近点要密集些因为正是曲线的拐弯处.情况好的话你就会拿到那个酶的Michaelis-Menten曲线(X轴底物浓度Y轴速度),处理后得到Km和Kcat.我觉得最后指定的测IC50的底物浓度要么是Km,要么是3xKm或5xKm(饱和).
当然如果你有决心的话,最好是做个关于抑制剂的全动力学以得出Ki.具体的方法 就是选5～8个底物浓度点,然后在每个底物浓度下测4~6个抑制剂浓度的反应速度,我一般是为保准确每个数据点重复2～3次,工作量不小,但是Ki不受其它因素影响,直接表征抑制剂对酶的结合能力,是适合发表的正式数据
当然如果你有决心的话,最好是做个关于抑制剂的全动力学以得出Ki.具体的方法 就是选5～8个底物浓度点,然后在每个底物浓度下测4~6个抑制剂浓度的反应速度,我一般是为保准确每个数据点重复2～3次,工作量不小,但是Ki不受其它因素影响,直接表征抑制剂对酶的结合能力,是适合发表的正式数据