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构建sRNA文库时提取总RNA还是miRNA

来源：学生作业帮 编辑：作业帮 分类：综合作业 时间：2024/05/24 14:33:01
构建sRNA文库时提取总RNA还是miRNA
最近在构建sRNA文库,想问一下构建文库时是要先提取总RNA,再切胶回收20nt左右sRNA,还是直接用提取miRNA的试剂盒提取miRNA就可以做呢,比如invitrogen的miRNA提取试剂盒
sRNA文库指的是small RNA么 那就不止是miRNA了吧 如果只是要miRNA 两种方法都行吧 试剂盒也只是用柱子把分子量大的RNA分离了
再问： 您的意思是只要提取的包括miRNA就可以是吧，试剂盒提取的是小于200nt的RNA，也就是说用试剂盒提取小于200nt的RNA可以构建文库吗？我现在的迷惑是不知道构建文库是必须用20nt左右的RNA，还是200nt以下的就可以做？
再答： 我觉得200以下就可以了 就算你跑胶回收20nt左右的 也肯定会有非miRNA的差不多大小的RNA存在 反正是建库 只要把miRNA都包括进去就好了 其实一般建库很少用成熟序列的吧 貌似用Pre的比较容易点
再问： 我看很多文献都是切胶回收，我要测序，是不是因为对后面的测序有影响呢
再答： 切胶回收的只包含20nt左右的 最终需要测序的数量少啊。。。。。 省钱噪音小
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