基因多重序列比对

来源：学生作业帮编辑：作业帮分类：生物作业时间：2024/05/29 14:36:54

基因多重序列比对

多重序列比对（Multiple sequence alignment；MSA）是对三个以上的生物学序列（biological sequence）,如蛋白质序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比对.一般来说,是输入一组假定拥有演化关系的序列.从MSA的结果可推导出序列的同源性,而种系发生关系也可引导出这些序列共同的演化始祖.如右图般的视觉化叙述可描绘出各种突变事件,例如点突变的单格变化,或是如删除突变与插入突变,可使各个序列之间产生鸿沟.MSA常用来研究序列的保守（conservation）,或是蛋白质结构域的三级结构与二级结构,甚至是个别的氨基酸或核苷酸.

怎样分析基因序列比对结果如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 动物dna序列为什么在ncbi上比对完和植物的该基因相似同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对? 基因序列BLAST比对时,Max ident 低于90%,可以做进化分析吗? 经过同源比对得到一个基因的序列,我怎样才能知道该基因的保守区域呢? 基因序列如何使用DNAMAN软件将测序的序列翻译成氨基酸序列?怎么和已知的基因进行比对?麻烦具体点,非常感怎样查找一种病毒蛋白所有不同亚型的基因序列?我想比对一下我这个蛋白的序列保守型, 想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢有谁知道NCBI blast检测基因序列比对结果怎么看的吗?求懂的大神们指教