想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢

来源：学生作业帮编辑：作业帮分类：数学作业时间：2024/05/15 12:27:19

想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢
希望各位能给与详细指导,谢谢大家

找近缘种,越近越好,的那个基因都下下来
ncbi或软件都可以比对,找高度保守区

具体操作为,蛋白序列和DNA序列都下,从连着7-8个蛋白保守区处比着DNA设计引物, 如果有四个是G,两个是A就选G, 要是一半一半就设计简并引物.
一个引物简并引物不能超过3个!

想问下各位高人,设计引物时没有所找物种的基因序列,想问下怎么进行多物种序列比对,找到相对保守区域呢我想克隆金银花的新基因,怎么通过其他物种找这个基因的保守序列啊! 如何读基因序列,设计引物时的保守区指那一段序列同一种酶不同物种中的基因如何进行多序列比对? 经过同源比对得到一个基因的序列,我怎样才能知道该基因的保守区域呢? PCR引物设计中的问题、保守序列在目的基因内、但是引物为什么在保守序列设计? 为什么判断两个物种亲缘关系的时候要比对高度保守的序列（16sRNA）? scleraxis的基因序列设计引物 ncbi上的基因序列是编码链还是模板链呢?如果通过基因名选择,出来是一个反向的序列,对引物设计有无影响? 已知下游引物序列,怎么去基因DNA上找到这个序列?如给定3-GTGTATGTGGCAATGCGTTC 我想找某基因的保守序列,不知怎么找,无从下手?急用, 怎样查一个物种某个基因的序列或亲缘关系较近的物种的基因序列