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是做基因克隆还是pcr产物直接测序?

来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:综合作业 时间:2024/05/23 22:06:28
是做基因克隆还是pcr产物直接测序?
我从某植物转录组测序结果中找到一个基因序列,结果预测是有完整ORF的,但我在orf两侧设计引物pcr产物直接测序,多次测序的结果在orf两端的序列都不同,orf是从99bp-1700bp,pcr测序结果在216bp之后的序列是多次pcr产物测序结果一致并且与转录组测序结果也一致,是包含polyA结构的.又已经设计了从1bp-500bp的引物企图扩增,但未得到产物.现在是在考虑要不要做5‘端race克隆得到包括ATG的99-216bp处的序列或者别的什么快速简单的方法能得到完整orf?是来做硕士毕业论文
看来你的植物材料没有基因组数据啊,这样的话5’-RACE是必需的,两头序列有了以后,直接设计引物从基因组DNA扩增以及从cDNA中扩增,找到内含子