有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成!
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:综合作业 时间:2024/05/04 19:13:21
有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成!
有两个fastaq格式的DNA序列文件,想同时把每个文件中每组断片的两端精度小于10的基因删除,之后再将每组平均精度低于30的断片删除,想写一个perl程序完成,无奈写不出,大体是这样的断片
@ERR013180.1 HWI-EAS-249_38:2:1:2:857/1
TTTTCTTGTTCTTGACTCTTCTGCATAAGTANTTAAATCC
+
BBBBBCBB=BCBB6BBBB6BB>.6,9@1'6,3B6'3,
@ERR013180.2 HWI-EAS-249_38:2:1:2:474/1
AACTGGCATTCACCCAAACCCCACCGACACCNGGTTTTAT
+
B7-=;;BB27?BBC@.33BBBBBB
有两个fastaq格式的DNA序列文件,想同时把每个文件中每组断片的两端精度小于10的基因删除,之后再将每组平均精度低于30的断片删除,想写一个perl程序完成,无奈写不出,大体是这样的断片
@ERR013180.1 HWI-EAS-249_38:2:1:2:857/1
TTTTCTTGTTCTTGACTCTTCTGCATAAGTANTTAAATCC
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BBBBBCBB=BCBB6BBBB6BB>.6,9@1'6,3B6'3,
@ERR013180.2 HWI-EAS-249_38:2:1:2:474/1
AACTGGCATTCACCCAAACCCCACCGACACCNGGTTTTAT
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B7-=;;BB27?BBC@.33BBBBBB
请给 精度 下个定义
再问: @ERR013180.1 HWI-EAS-249_38:2:1:2:857/1
TTTTCTTGTTCTTGACTCTTCTGCATAAGTANTTAAATCC
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BBBBBCBB=BCBB6BBBB6BB>.6,9@1'6,!3B6'3,6?
第二行是断片 第四行是对应第二行的精度 转成ASCII码再减33 就是精度了! 谢谢
再问: @ERR013180.1 HWI-EAS-249_38:2:1:2:857/1
TTTTCTTGTTCTTGACTCTTCTGCATAAGTANTTAAATCC
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BBBBBCBB=BCBB6BBBB6BB>.6,9@1'6,!3B6'3,6?
第二行是断片 第四行是对应第二行的精度 转成ASCII码再减33 就是精度了! 谢谢
有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成!
手头现有1个DNA文件(fasta格式),序列比较长,可能有100kb,现想从中提取特定位置的序列.
求一段perl分割fasta中DNA序列的代码 fasta文件中有数千条DNA序列,都是按照注释,
有一个perl程序,中state的用法错误
利用MATLAB函数文件,完成任意两个序列的卷积
求perl的统计程序,统计病毒序列中的ATCG总数,以及各个核苷酸所占比例【病毒DNA中有四种核苷酸,即ACTG】
perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.
如何运行一个perl程序
用perl语言测DNA序列,全部分给你!
求助一个程序(perl程序)
如何用perl读入一个文件,计算文件中各个单词的出现频率,再输出
帮忙修改一个计算DNA序列中各个密码子出现次数的程序.