16s细菌鉴定blast操作过程
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/15 11:45:45
还需要和菌种的形态学观察、生理生化结果(参照《伯杰氏细菌手册》第8版相关内容进行)综合参考才能得出结论.再问:好比说我现在16srDNA鉴定到了属,接着就从这个属开始做一些生理生化实验,最后得出结果吗
一般用有刻度的玻璃管,来检验.密闭容器,接带有液滴的玻璃管和阀门,阀门气压平衡后,关闭,一段时间后观察液滴的移动. 和这个图大同小异再问:麻烦您能告诉我具体的操作方法吗?谢谢
ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection(nr/nt)选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问:这一
一淀粉水解试验(一)实验原理细菌对大分子的淀粉、蛋白质和脂肪不能直接利用,必须靠产生的胞外酶,如淀粉酶、蛋白酶和脂肪酶将大分子物质分解.胞外酶能分泌扩散到细胞外,将物质分解成小单位如糖、氨基酸、甘油与
那你用鉴别培养基培养一下吧,再通过菌落的型态鉴定一下吧再问:已经刷掉了……枯草芽孢杆菌是否符合我观察这几个的特征?再答:对不起,我不知道为什么芽孢会有这么多的生长位置,按理说不应该啊,还有,你是怎么确
需要做很多生理生化指标.常做的有,硝化,产酸,产气,等等.你先鉴定到属,然后根据“伯杰氏细菌鉴定手册”上的指标.同时,辅以分子生物学鉴定,扩增16S片段,做系统发育树,两者结合.
就会很开心
为了确定哪种抗生素对宝宝体内的病毒作用更好,或者是用于鉴定细菌对哪些抗生素抗药了❤您的问题已经被解答~(>^ω^
酚红试剂
--16srDNA不是提取出来的~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA.然后你把PCR产物纯化一下送交测序公司测序,
你是指V.P.实验吗?
每种细菌的生化反应基本是不同的.生化鉴定管有组合的和单支的.一般弧菌科细菌用对应的9管组,肠杆菌科也有对应的组合.当然已知种类的细菌可以用对应的单支生化管来鉴定.
纸色谱法是属于分配色谱的一种,通常用特制的滤纸如新华一号滤纸作为固定相(水的支持剂),含有一定比例的水的有机溶剂(展开相)作流动相,应用于多官能团或高极性化合物如糖或氨基酸的分离、鉴定.Rf比移值是一
就是通过测定16srRNA的序列来对病原菌进行定种.16srRNA鉴定是很经典的微生物定种方式啊.再问:有没有这方面的资料推荐,非常感谢再答:这个太多了,谷歌学术里一搜一大把。
通用引物1492r/F27,pcr后去测序,因为测序软件的自身原因,测出来开头的序列是杂带不准确,如果需要16sRNA的全长,必须做TA克隆,就需要载体的问题了.如果你要求鉴定菌种只到属,完全可以用通
分两步,一、形态学鉴定,要从形态学上初步确定菌株可能是哪一类菌,二、1、选择合适的引物,2、提基因组3、PCR扩增4、连接载体5、筛选阳性克隆6、测序7、NCBI比对同源性
操作步骤1.涂片将培养14—16小时的枯草芽孢杆菌和培养24小时的大肠杆菌分别作涂片(注意涂片切不可过于浓厚),干燥、固定.固定时通过火焰1—2次即可,不可过热,以载玻片不烫手为宜.2.染色(1)初染
先做生理生化鉴定,对照伯杰氏细菌鉴定检索表,确定是哪个属,再在里查16sRNA的DNA数据设计引物,做PCR扩增,测序,再对照GeneBank里的数据分析同源性
这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,
因为我现在读高二,所以生物刚学.所以蛋白质的鉴定也这星期刚学好.我现在说的都是书上写的.你参考一下吧.取2毫升样本上清液加入2毫升双缩脲试剂A(NaOH),振荡试管,使样本与试剂A混合均匀,再加入5滴