作业帮NCBI蛋白比对的identity 和covery
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/08 12:17:33
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
用contig1软件将上述两段序列拼接后,用拼接结果的反向互补序列进行BLAST.BLAST结果显示,你的菌株与动物乳杆菌,鼠乳杆菌,乳酸乳球菌Maxident均为96%.
ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection（nr/nt）选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问：这一
觉得可能是theproteincoveragesummazer(pcs),这个我没有用过……
你在NCBI主页上找一个BLAST.这是一个序列比对在线工具,自己摸索使用啦.基本的序列比对功能一定可以满足的.
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
1）输入fasta格式序列2）选择核算比对
访问号：NM_001127660.1——变体1TranscriptVariant1:Thisvariant(1)representsthelongertranscript.NM_014874.3——变
举个例子吧.搜索GI号为386311839的蛋白质进入NCBI主页,选择Protein数据库,输入GI号,点击search然后就OK了.
那个检索页上应该会附有参考文献的,你去下载看看就知道了.一般看摘要就可以知道是什么功能.如果没有参考文献,你就去NCBI上的pubmed中检索这个蛋白,可以找到类似的文献就可以知道其功能了.具体工作还
你在用DNAMAN的多序列比对时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你测序得到的目的片段可能是非编码链（即你目的基因的编码链的互补序列）,而NCBI中提交的序
动物和植物也有同源性嘛,都是由单细胞生物进化来的,拥有共同的祖先.你这段DNA片段是什么基因的?
首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popularresources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotideblast”.进到那个页面有个框就是
直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问：我只是在做我的本科生毕业论文，所以不咋看得懂，我现在主要就是结果那块看不懂，不知道怎么分
原理很简单后者是前者的子集.chromosome只包含所有已经测序的基因组数据.估计你的序列可能只是在高等生物中保守,所以才会出现选择chromosome数据库时相似数量下降非常多.在做BLAST的时
对于猪来说豆类蛋白氨基酸种类较全牛.羊是复胃动物主要依靠瘤胃细菌产生的菌体蛋白直接食入大量蛋白质需考虑过瘤胃否则无法直接吸收（细菌利用了）而且可能引起瘤胃鼓胀等疾病
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
同种属同一基因相似性99%以上,只有个别密码子第三位突变,需要翻译为蛋白序列比对,相同即为同一基因..
cry1ab/cry1ac
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多