ncbi中c查找mRNA 序列
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/18 08:57:05
在NCBI的点击 Pub Med,在后面输入你要查询的相应的基因的名称,就会把所有NCBI登记在案的mRNA序列显示出来了,包括很多物种的,
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
NCBI要好好学啊先用Google翻译成细胞色素c为CytochromeC在NCBI下列表中选择gene后面填上CytochromeCyeast(酵母的血红蛋白意思,别把中文放上去了哈)有COX9、C
ncbi上面有那个具体的网页很容易找的你确定改片段的名称以及物种就可以
直接查基因序列就行啊,查什么mRNA啊.直接搜WheatwrkyTranscriptionfactor,找到14条GENE,选你想要的打开连接,里面有Relatedsequences这一项,里面有基因
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
Amphiprionfrenatus:白条海葵鱼(一种观赏鱼)voucherFMNHBus03-5T-128:编号FMNHBus03-5T-128bonemorphogeneticprotein4ge
CDS(codingsequence)序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列.在NCBINucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列在出现的结果中,有CDS这一项,底下的核酸序列就是该
在genbank中搜索cytochromeCmRNA,应该可以,不过最好再多几个关键词,比如哪个物种
举个例子吧.搜索GI号为386311839的蛋白质进入NCBI主页,选择Protein数据库,输入GI号,点击search然后就OK了.
首先,向NCBI提交序列后,会有专门人员进行初步筛选,把那些有明显错误的序列筛除.剩下的是无明显错误的序列.其次,这些NCBI里的序列不可能全是正确的,有很多也是错误的,只是初筛时未发现这些错误.最后
找到一个物种的mRNA序列,用mRNA的序列去进行blast,找同源性高的序列,找不同物种的.就可以了
直接用关键词Homosapiensmitochondrion在genome数据库中搜索就行了.找completegenome这是找到的.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/site
因为NCBI是按模板链给的,毕竟基因间的比对用得较多,改成U太麻烦,你自己知道mRNA中T应该是U就好了
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
GI编号是NCBI网站的所有序列相关数据库的流水编号,其最有用的特征就是唯一性.对于每一条递交给NCBI的序列,都会付给一个编号,而且这个编号对应的序列不可更改.这个编号对应这个唯一的一条序列,类似与
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中
KEGG网站更容易,输入基因名,点击othorloggenes查看下拉框即可再问:不行没查到可能是我也不会操作吧再答:1、NCBI选择nucleotide,输入基因名,获得该基因某物种的序列。如果已经
ncbi序列既有cDNA序列也有mRNA序列,一般会有注释的.如果已经说明是mRNA就不可能是cDNA.mRNA是以正义链的形式给出的,所以是T而不是U.这可能是因为序列提交者一般只对DNA测序,而很
如果你在NCBI查到一个基因,在summary栏目的下面紧接着就是一个叫做“Genomicregions,transcripts,andproducts”的栏目,是一个图,左侧有蓝色的小字“NM_……