作业帮blast 序列结果 cover百分比
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/21 11:30:13
参考序列说明失败但是有序列存在供您参考!比对所得序列是否准确.
1）输入fasta格式序列2）选择核算比对
什么跟什么说的太不清楚饿了只要你需要的那段序列是对的不就行了嘛跟引物序列有啥关系毕竟大部分的PCR引物设计都是在需要的序列两端隔一段距离而且如果你测序是拿PCR引物测的话那前面的几十个碱基都是测不准的
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考：http://liucheng.name/475/
不太明白你想问什么.用vectorNTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了.若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点.
$ grep-n“seqs1” |less如果想输出到某个文件|less改为>youwant.txt再问：��д��ϸ�����ҵ�perl��Ϊ0.000000
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
Blast出来的是一系列和你提供的序列很相似的已知序列~并进行比对,列出相似度等信息.Entrez是和PubMed连锁的,一般是通过已知核酸序列查蛋白产物,和相关文献什么的~
直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问：我只是在做我的本科生毕业论文，所以不咋看得懂，我现在主要就是结果那块看不懂，不知道怎么分
看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.
把目的基因链接到受体基因上在分析产物蛋白.嘿嘿
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
没事,这个可以,你应该是把设计的上下游引物都进行了比对,前两个比对结果应该就是上游、和下游引物,假设你第一个结果是上游,第二个结果是下游.那么第三个结果也就是下游比对结果,下游结合的位置距离上游、下游
对上面这个页面进行一下必要的介绍：BLAST的这个页面主体部分（左面）包括了三部分：BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂
使用blastn里面的 “Align two or more sequences”,出现两个输入序列的窗口,分别输入基因组序列和mRNA序列,mRNA
可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多
你确定是两个不同的基因吗?会不会是同一基因的不同的可变剪切类型再问：是根据模式生物的不同基因的片段对得到的转录组进行blast查找，结果显示找到的是同样的序列。再答：或者就是你的那两个的基因不完整，可
部分区域相似,且相似度很低.分值越高越相似
将人和猪的该基因序列或氨基酸序列进行同源性比较,找出同源性较高的保守区,以此保守区与genbank中鼠的基因序列或氨基酸序列进行比较,找出同源性较高的区域,对该区域进行分析,找出含有该区域序列的ORF