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某一基因序列 由于只能查到人的和鼠的 请问 怎么通过已知的人和鼠的基因序列 blast出相应猪的基因序列

来源：学生作业帮 编辑：作业帮 分类：综合作业 时间：2024/05/11 19:49:21
某一基因序列 由于只能查到人的和鼠的 请问 怎么通过已知的人和鼠的基因序列 blast出相应猪的基因序列
将人和猪的该基因序列或氨基酸序列进行同源性比较,找出同源性较高的保守区,以此保守区与genbank中鼠的基因序列或氨基酸序列进行比较,找出同源性较高的区域,对该区域进行分析,找出含有该区域序列的ORF即可.
再问： 非常感谢你的回答 可是在NCBI上只能搜到人和鼠的基因序列 没有猪的 我是要扩猪的该基因的启动子
再答： 如果没有猪的该基因序列的资料，也可以做，但比较麻烦了。建议采取的方法是，提取猪的mRNA，反转录成cDNA后， 方法1.以人和鼠该基因的同源序列设计引物进行PCR扩增，具体可采取5'或3'RACE的方法。 方法2.建立cDNA文库，用以人和鼠该基因的同源序列设计探针，与文库进行核酸杂交，筛选出阳性克隆进行测序。 通过上述2方法得到的可能不是该基因的全长，而是部分基因，但可以以此为线索，继续获得该基因的全基因及其两侧的序列，然后用软件寻找启动子序列，并用启动子探针载体检测或验证启动子的活性。
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