下游引物在原序列中找不到
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/16 08:04:59
你去找各大公司的产品手册,上面会有非常详细的随机引物的序列,随机引物非常的多,有上百种
FPrimer:5'-TTGTAAAAAAATTAAATTAA-3'RPrimer:5'-CATATTTTAATTAATATTTC-3'你这个序列AT含量太高,尤其是5'端A有7个连续重复,引物本身很
上游:5ggaattcatgtttagtttgaaaaaaac3下游:5gggttcgaattagacattgccaacatatt3你要的并不是鉴定引物,而是扩增引物根本不用软件
引物设计原则:1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性.2、G十c含量
一定要的.正向引物:5'.CTTCGAAATTC3'反向引物:5'.CCGATCGGGAGA3'回答楼主的补充问题:设计正向引物时,该引物序列应该具有和你待扩增DNA序列接近5‘段处的序列.反向引物设
如果该ATG是翻译起始位点,就没有蛋白翻译了.如果是inframe编码,就会少一个氨基酸再问:少了一个蛋氨酸,我的蛋白就是残缺肽了。。。那样子做相互作用会有影响吗?如果有结果了,实验数据可靠不?再答:
cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.
试试primer软件.
DNA是一个长长、具有方向性的线性分子.对于DNA的一条单链来说,它的起始端被称为5‘端,末端被称为3'端.相应地,5’端也就被称为上游序列,而3‘端被称为下游序列.
上游引物:GAATTCacgcgcaagattagg(后面可以继续加几个碱基,用PRIMER5.0看一下,引物设计多少个碱基合适,每个基因序列不同.我用TOYOBO的KODPLUS的话,就一般引物设计
5':CGGAATTCACGCGCAAGATTAGGTGGGG3':CGGGATCCCCTTGGGAAGAAAAAGCAAG引物组成为:保护碱基+酶切位点+目的基因末端序列.由于你要扩增全部这段序列,
对于这种情况,如果你只是找不到扩增引物的序列,但是能找到后面所要扩增的序列的话,那么可能还是因为测序引物离你的扩增片断太近.如果不是这种情况,那么可能是你根本没有将扩增片断成功连入当然还有一种可能是公
一般对于已知序列的PCR当然不要从保守序列来设计引物,只要从开放可读框前后开始设计就行了.需要从保守序列设计引物的情况一般是两种,一是某个物种里面某个特定基因序列从未被分离过,但其进化关系相近的物种有
在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18记作3.2E18,即E=Exponent,指数;幂再问:5e-04,即表示5×10^-4。谢谢再答:嗯,对的!
一般来说,RT-PCR的时候很多情况下会不知道模板DNA的序列,可以在Genbank中寻找和你要扩增的物种的亲缘关系较近的物种的同源基因,多找几种,用DNAMAN或其他软件可以比对它们的序列,这样可以
[color=red][/color]4.28送菌液去某公司测序,昨天收到的测序报告连上下油的引物都找不到.后来我又做了菌落PCR(设阳性,阴性对照)有目的条带.请问各位是什么原因啊?测序结果上不会有
引物有一条和模版的序列相同,而另一条和模版的序列反向互补,上游和下游是自己定的,分别位于模版的两端
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握
VAR需要平稳序列.如果想用不平稳的原序列的话可以考虑误差修正模型(ECM).误差修正模型是有约束的VAR你可以理解为升级版的VAR(所以不平稳才能使用)再问:但是,在好多文献中,看到非平稳的序列也建
运用DNASTAR软件把DNA序列反向互补,然后再用引物去匹配就可以了