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原核基因在大肠中表达存在密码子偏爱性吗?

来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:生物作业 时间:2024/05/29 02:49:20
原核基因在大肠中表达存在密码子偏爱性吗?
我在做芽孢杆菌一个蛋白的异源表达,基因克隆了,用的pET-28a,表达菌株是BL21(DE3)pLysS,测序也没有问题,25℃、30℃、37℃都诱导了,IPTG为0.5mM.可就是不见表达,所以我在考虑是不是因为稀有密码子的问题,
是的原核表达这是个很重要的问题 如果你的基因ORF中存在稀有密码子 会严重影响表达 尤其是Arg(AGG,AGA,CGA);Leu(CTA);ILe(ATA);Pro(CCC).当然重复存在更增加了表达的难度.
如果你的稀有密码子比例不是很大 可以用Rosetta菌株试试 它补充了一定的大肠杆菌稀有密码子
但是如果比例很大就不可以了 考虑自己合成基因好了
我的片段就是 含40%稀有密码子 检测组蛋白有表达信号 但是基因不表达
再问: 谢谢你!我是在线分析的,表明稀有密码子是分散在目的基因中,基因全长2700bp左右,稀有密码子不到20个,没有串联。我之前一直以为只有做真核基因的表达才会涉及密码子偏爱性问题,我做的原核基因,由于一直没有表达所以我采开始怀疑是这里出了问题。像我这种情况,用Rosetta感受态ok吗?
再答: 应该是的 稀有比例不是很大 但是 不能说一定可以 你可以用来试试 实验嘛 还有就是你看下说明 并不是补充所有的稀有密码子的 希望你的会在菌株中有所补充 做原核表达还是很说不好的东西 如果没有表达 那原因就多了