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您好,看到您对“如何用blast比对两个蛋白质序列,看它们之间有多高的同源性 ”问题的回答,想必阁下对两种

来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:数学作业 时间:2024/05/28 14:40:17
您好,看到您对“如何用blast比对两个蛋白质序列,看它们之间有多高的同源性 ”问题的回答,想必阁下对两种
蛋白质同源性分析有深刻的体会,在下是医学院在校本科生,参加本科生科研活动时遇到了一个问题,而导师在美国还未回来,于是想向您请教一个问题:我的目的是为了比较果蝇lamin蛋白与大鼠的nestin蛋白质的同源性,比对结果max score:40.0,Total Score:57.4,Query coverage:12%,E-value:9e-07,这个结果算同源性高吗?此外,这样的结果能不能说明果蝇的lamin可能被抗大鼠nestin蛋白的单克隆抗体标记上?十分感谢您.另外,我也想知道,对于两种蛋白质同源性高与否是否有公认的标准?
序列比对结果有一个identify 参数,identify 参数有一个是数值结果,有一个是百分数的结果.是否具有同源性以identify 参数的百分数结果为准,如果达到40%或者以上就叫做有同源性,中文就叫说序列相似性达到40%则认为两条序列就有同源性.在NCBI上有一个BLAST的文档,不过比较难理解,如果你兴趣十分浓厚的话可以看一下,如果兴趣不是十分的强烈就算了!