关于基因组组装的问题,请问我如何去寻找被打散了的基因序列呢~

来源：学生作业帮编辑：作业帮分类：政治作业时间：2024/05/15 01:45:32

你是说使用类似鸟枪法测序时候如何讲所有的序列拼接起来是吧?
是这样的,在一次测序中,一般会打碎很多很多很多的细胞基因组,因为是随机打碎成100-200bp的小片段,那么来自不同基因组的小片段之间是会有重复序列的,在人类基因组工程里的标准是有50bp的碱基对匹配就将两个片段拼接在一起,然后再去找他们两端的序列,50bp匹配,就拼接.一点一点像拼图一样拼起来.通常在同一个位置上至少需要20个片段覆盖才算是确认无误.然后还需要一些之前知道的知识,比如哪个基因在哪个染色体上,拼出带有这个已知基因的片段就是该染色体的片段~
具体的原理如果有兴趣欢迎追问~希望对你有所帮助~
再问：是的就是鸟枪法测序时获得的学列，老师布置到的作业就是用软件对基因组进行组装，我想知道如何去下载这些被打散了的序列。不知道您能不能告诉我一个下载序列的地址诶～～～谢谢
再答：你去搜索一下DNA star，里面的seqman就是序列拼接的工具，不过如果是大规模的我不知道行不行，你先搜搜看，因为这个方面我也是了解，并不是太深入的做过~ 本来想钻研一下，无奈最近事情比较多。。。我们可以保持联系，以后也可以多多讨论~
再问：老师说在blast里面有但是还是没有找到
再答：你先去试试DNAstar吧。。。这个不行么。。。
再问：我有DNAstar但是木有序列诶~~~~

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