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我现在提土壤总DNA,DNA提不出来,可是用16srna可以扩出来,这是怎么回事呢?

来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:综合作业 时间:2024/05/08 00:34:58
我现在提土壤总DNA,DNA提不出来,可是用16srna可以扩出来,这是怎么回事呢?
你怎么知道提不出来?提DNA时有没有DNA被提取出来不能用眼睛判断,即便用分光光度计测量或用电泳后染色也不一定行,主要要看土壤中的DNA的量的多少,PCR的灵敏度很高,因此只要有极其微量的微生物DNA,就能扩出来,当然你要排除是污染的.
再问: 恩 你说得对啊,不过我提完后有白色的晶体,加水就溶解了,不知那是什么?可是老师要求看到DNA才行。否则后面的就没有说服力。
再答: 白色晶体是盐,你在哪一步用了太高盐浓度的溶液,或者在抽提缓冲液中有盐,沉淀DNA前又加了盐溶液,用70%乙醇洗几次或者加水溶解后重新沉淀能逐渐减少。一定要看到DNA的要求是不对的,老师的说法不一定对,除非他知道样品中的DNA量。
再问: 没有呀,缓冲液我都没有加盐的,今天有做一批,还是没有呢。急死了!有联系方式吗?想具体i向您请教。
再答: 如果只用TE缓冲液的话就应该注意TE的配方,Tris 是10mM,EDTA是1mM,如果用了母液那肯定会沉淀,特别是EDTA;还有就是SDS,在消化液中会加,有时也会随乙醇沉淀出来。
再问: 我今天对样品进行了洗盐,然后发现晶体没有那么多了,可还是提不出来,只有一个样有,也不是很亮,是不是里面的杂质没有除干净?
再答: 提DNA的好坏最关键还是样品的质量,如果样品中都没有多少DNA的话怎么可能得到足够多的DNA呢?组织样品提到足够多的DNA是合理的,而土壤样品的DNA量完全无法简单推测,如果没有把握,不必追求眼睛或直接染色就能看到的量。如果一定要提高产量,第一,需要增大样品量,第二需要减少每步抽提的损失。但增大样品量意味着抽提缓冲液的体积也大大增加,当你沉淀时,从样品以及缓冲液来的盐分也会大大增加,你可以在沉淀DNA前加醋酸铵而不是醋酸钠,沉淀DNA时采用异戊醇,还可以增加洗盐的次数;减少每步抽提的损失要注意接近界面时水相的收集,将界面水相转移到一个直径小的离心管中,再进行离心分层后能回收得到更多的水相;如果样品的多糖或粘蛋白含量高,还可采用CTAB这种阳离子表面活性剂代替SDS进行抽提。方法很多,建议你参考Current Protocols
再问: 恩 我是CTAB-sds结合的方法,明天打算用液氮法,看其结果怎么样,其实ctab是比较经典的方法了。可是土样不一样,就要用不同的试剂和方法,我现在必须要提出DNA,因为若果就这样往下做我觉得会有问题,因为引物有偏嗜性。不过谢谢你了,辛苦了。我的QQ:125622910.希望以后有机会可以向您请教更多的问题。
再答: 我电脑上不装QQ,很少上,遗憾。
再问: 啊? 那您有邮箱吗?
再答: 这个账号上留了,看不到吗?
再问: 没有的。
再答: 不想公开,垃圾邮件太多。
再问: 哦 这样呀?好吧。只想和您做个朋友。
再答: 有问题给我提吧,有时间尽量帮助。