16S rDNA序列BLAST结果-搜答案-智慧作业帮

参考序列说明失败但是有序列存在供您参考!比对所得序列是否准确.

1）输入fasta格式序列2）选择核算比对

什么跟什么说的太不清楚饿了只要你需要的那段序列是对的不就行了嘛跟引物序列有啥关系毕竟大部分的PCR引物设计都是在需要的序列两端隔一段距离而且如果你测序是拿PCR引物测的话那前面的几十个碱基都是测不准的

不太明白你想问什么.用vectorNTI等软件可以对两个序列进行序列比对,给出的positive值就可以看出同源度了.若同时拿家族中3个序列进行比对,就可以得到进化树,更直观一点.

$ grep-n“seqs1” |less如果想输出到某个文件|less改为>youwant.txt再问：��д��ϸ��ҵ�perl��Ϊ0.000000

北京三博远志16srdna测序/鉴定说明：1、样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA.2、如果样品为基因组DNA,DNA浓度>20ng/ul,体积大于20ul.3、鉴定结果一

把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦

Blast出来的是一系列和你提供的序列很相似的已知序列~并进行比对,列出相似度等信息.Entrez是和PubMed连锁的,一般是通过已知核酸序列查蛋白产物,和相关文献什么的~

看你的实验目的啊.如果只想做个片段,那就进行下生物信息学分析,比如多重序列比对、生物进化树分析、蛋白质结构预测等.

--16srDNA不是提取出来的~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA.然后你把PCR产物纯化一下送交测序公司测序,

这有啥好系统讲的,单端测序的数据比对一下就完了,还能咋样?

把目的基因链接到受体基因上在分析产物蛋白.嘿嘿

V3区是在通用引物所扩增的序列的一部分.V3区引物的变异性相对于通用引物27F/1492R而言更高.

对上面这个页面进行一下必要的介绍：BLAST的这个页面主体部分（左面）包括了三部分：BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂

使用blastn里面的 “Align two or more sequences”,出现两个输入序列的窗口,分别输入基因组序列和mRNA序列,mRNA

可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的

双向测序得到的两个序列如果有重叠区的话,那么可以做拼接.另外NCBI的blastn可以做两个序列的比较,通过blastn比较可以看两个序列有没有重叠序列.做拼接有专门的软件,如DNAstar里面的Se

你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多

部分区域相似,且相似度很低.分值越高越相似

将人和猪的该基因序列或氨基酸序列进行同源性比较,找出同源性较高的保守区,以此保守区与genbank中鼠的基因序列或氨基酸序列进行比较,找出同源性较高的区域,对该区域进行分析,找出含有该区域序列的ORF