设计一段已知DNA序列的上下游引物
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/21 20:34:46
一般未知的序列旁边都有已知的一段吧,就是你说的“修饰片段”?PCR这种flankingsequence可以有很多方法,比如TAIL-PCR,用ADprimer(简并引物)和特异性引物就可以得到目标片段
生物信息学方法查找相关物种中的这一转录本的序列,然后根据保守序列设计兼并引物.提取转录这种转录本的细胞中的RNA,在利用引物扩增出CDNA.这样就获得了这样转录本的全长.
因为你知道一段序列,也不说有多长,感觉最简单就是到NCBI做BLAST,设计引物PCR的话估计不太现实了.基因组测序飞速发展,估计能BLAST到的,然后就好办多了.真核生物要考虑到内含子,略加注意应该
病毒的DNA序列或缺陷基因的序列把缺陷基因的双链加热解旋成单链或病毒的RNA单链用32P或荧光分子标记单链被标记的单链就是DNA探针DNA探针引入被测者细胞内,出现DNA分子杂交就证明有该病毒或该基因
1.先做序列分析.看是编码序列还是非编码序列.如果是编码序列,则看所编码的蛋白质功能.非编码序列,到Google上搜promoterprediction.然后输入你的序列.可以推测该序列作为promo
我很奇怪,你写的序列怎么没有方向呢?哪端是3’端?哪端是5’端?如果开头那个部分是5’端的话,你的一对引物的序列分别为:5’—gaatgtacgtgccgc—3'5'—actagctacaatcc—3
把这段基因输入设计软件里,调节引物位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-(5到10度)延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物.如果你要扩增整个的基因
NCBIblast,看看同源的序列是什么基因和功能,那你这也差不多就是什么基因和功能.
是已知的,因为DNA探针中的碱基要与被探测物质的碱基配对才能检测
好像用这个软件设计引物的很少吧,我一般都用PrimerPremier5,或者oligo7.这种专业软件很多专业论坛都有说明书下载,比如生物秀、丁香通、生物谷什么的.
由于没起始密码子,所以从左往右写就行,正好30个碱基这道题有两种答案1、如果按它是编码DNA,就写出它的另一条链的碱基序列,然后对照密码子表写出氨基酸序列2、如果按它是非编码DNA,就直接查表写出氨基
引物设计原则:1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性.2、G十c含量
提取脑组织的基因组,设计引物,PCR,连入载体转化表达宿主,蛋白表达纯化
这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.
DNA是一个长长、具有方向性的线性分子.对于DNA的一条单链来说,它的起始端被称为5‘端,末端被称为3'端.相应地,5’端也就被称为上游序列,而3‘端被称为下游序列.
提出了一种改良的TDT加尾克隆基因5对于基因组测序已经连接载体的PCR是利用已知基因组DNA序列设计的特异引物和载体通用引物进行扩增
这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握
看定义密码子:由3个相邻的核苷酸组成的信使核糖核酸(mRNA)基本编码单位.有64种密码子,其中有61种氨基酸密码子(包括起始密码子)及3个终止密码子,由它们决定多肽链的氨基酸种类和排列顺序的特异性以
运用DNASTAR软件把DNA序列反向互补,然后再用引物去匹配就可以了