用于诱导表达的引物设计
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/10 13:04:44
可以这样来说吧,首先你应该有一条已知的序列,反向引物设计时在序列的5'方向找一段序列然后反向互补作为反向引物,在3'方向直接找一段序列作为正向引物.这样就OK了,这是引物的设计,至于其他条件可以参考相
引物的设计一般要考虑以下几个问题:1.长度,至少要16bp,通常为18-30bp2.解链温度(Tm值)3.避免引物内部或引物之间存在互补序列(3个碱基),从而减少引物二聚体的形成以及引物内部二级结构的
请用primerexpress设计就行.你想去找非常保守的区域设计引物?可以,那你把这个物种的所有亚种的此段DNA序列做一个保守型分析就行.一般来说clustalX就可以了.再问:ClustalX排列
不用那么复杂网上那都是扯淡的主要是这么几点注意的:1.碱基组成,GC的含量2.引物长度3.不能有反向重复和自身互补序列4.Tm值5.3端最好为G或C等等设计时最好用软件弄一下不用面面俱到没有太大问题就
构建载体需要酶切的,所以需要加接头的!
引物可以通过一些软件设计,比如primer5,但是还需要注意一些细节问题.比如1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计.DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的.在NCBI上搜索不同物种的同
如果你测定的基因序列未知,可以用同源基因或者别的物种的同类基因序列来设计引物,进行PCR,看看是否能够扩增出产物,并对产物进行确认,判断扩增的特异性.如果确认无误,就可以进行荧光定量PCR.再问:我想
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/194473617?report=genbank
因为你是设计半定量RT-PCR的引物,所以你并不需要全长的ORF,只要一部分序列就可以了.这样你在设计引物的时候,将内源基因和外源转入基因进行比对,选取二者特异性的区域设计两对引物.一对是内源基因的特
您应该使用巢式PCR来做这个实验.无论您是先提RNA再做反转录,还是直接从DNA中获得基因,考虑到模板的复杂性,都应当使用巢式PCR.建议您先从目的基因的上下游设计一段引物,即外引物,再根据目的基因上
PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列.因此,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否.要设计引物首先要找到DNA序列的保守区.同时应预测将要扩增的片段
跟一般的PCR一样哇,PrimerPremier、Oligo都可以哦.
比如说用primer3,你就把找到的包括这个SNP的一段序列copy进去,在你的snp周围用方括号包括一段序列,然后让primer3设计就可以了
一般使用primer5就挺好,不知道你是扩基因还是启动子,基因是否是已知.PCR引物设计原理:PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列.因此,引物的优劣直接关
直接设计只要包含了整个CDS区就可以再问:哦,那CDS和ORF是一样的吗,怎么查找基因的CDS区啊再答:恩差不多回事ORF是DNA上的CDS是mRNA上的看你模板用的是基因组DNA还是cDNA了反正就
你是直接用primer5设计的引物吗?有时候时会遇到你说的问题,你可以在软件设计出来的基础上,手动的把你的引物移动几个碱基,可以减少一些二聚体或错配,而且,软件给出来的这些结果都只是计算值,你实际应用
通过TA系统连接上的,因为PCR末端有产物体A,而pCRTM2.1载体上有T,可以通过TA配对而构建的.再问:谢谢,我对这个不是蛮懂,还有一个疑问,就是,引物的5端不就是p出来的产物的5端吗,既然引物
设计引物应遵循以下原则: ①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右. ②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段. ③引物碱基:G+C含量以40-60%为
你打算用载体上的启动子是吧,设计引物的时候,把目标序列cDNA全长都扩增进去就行了.上游引物肯定要有基因起始密码子的.不过,你的问题中,“5'端增加的酶切位点中”这句话有问题.5'端是需要增加酶切位点
我觉得不用吧计算Tm和退火不是算的双链部分的嘛不用计算附加碱基,如果要调整PCR的特异性,只是提高退火温度就好了,这个提高不是以附加碱基为基础的.克隆实验倒是无所谓,如果你是要在附加碱基中加入一个小T