用NCBI怎么对比两个物种全基因组的同源性?最好能具体点,谢谢
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/12 06:15:50
在NCBI的点击 Pub Med,在后面输入你要查询的相应的基因的名称,就会把所有NCBI登记在案的mRNA序列显示出来了,包括很多物种的,
搜到的序列有些是包含基因所在的染色体片段的,所以很长;有些是该基因的全长序列,包括基因的编码区和非编码区;cds的就是基因的编码区序列.主要看你的目的来选择的.
进入NCBI主页http://www.ncbi.nlm.nih.gov/在第一个下拉菜单Search那一栏中选上gene然后在搜索框中填上基因的名称,还可以加上种属名,如人是Homosapiens以上
therarespecies
一般进入NCBI界面,选择GENE,输入FeSOD,物种名,比如人,homo,查询就可以导出,氨基酸序列也会跟着出来,如果没有,可以通过超链接查找,或者把GENE改成protein,同样查找
这个问题要是能够完美回答就没有那么多国内外生物学家仍在努力奋斗了.事实上,全基因测序得到就如一本“天书”,我们还是像以前那样,比如研究某个基因,任然要做很多实验,各个层次的,分子的蛋白的,研究基因产物
www.pubmed.gov搜索框的下拉菜单选Nucleotide,框中输入基因名,点击Search,或按Enter键.
你说的应该是野猪(Susscrofa)的基因组从以下链接的图中可以看到complement那段说的就是一个基因名字为LOC100622239,这个基因的特点就是,相对GUCY1A3而言,它是向另一个方
访问号:NM_001127660.1——变体1TranscriptVariant1:Thisvariant(1)representsthelongertranscript.NM_014874.3——变
那个检索页上应该会附有参考文献的,你去下载看看就知道了.一般看摘要就可以知道是什么功能.如果没有参考文献,你就去NCBI上的pubmed中检索这个蛋白,可以找到类似的文献就可以知道其功能了.具体工作还
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
看性质可以翻译一下在看嘛
1,如果你知道基因名称的话,进入NCBI主页,在选项后面选择GENE然后输入你要查找的基因名称.2,如果你知道基因序列的编号,选择NECLEOTID然后输入你的序列ID即可3如果你知道有关基因的部分信
查mRNA的话,在NCBI主页上AllDatabases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧TopO
我可以告诉你,那是不可以能的.一个物种所包含的蛋白质有多少种?NCBI中储存的数据是按照单个蛋白质序列贮存的,而且都只是序列,NCBI不是二级结构数据库,要找二级结构去PDB找,在说了,就算你找到了所
一就是可以尝试测定该物种特有的基因片段,如果都有就是同一物种.(不知道可不可以,我自己想的还有一种就是常用的,同一物种是不存在生殖隔离,彼此可以互相交配产生可育的后代.比如马和驴子就是不同物种,虽然能
Comparedwithincomein1954,itincreasedto8.5billonin1993.Comparedwith表示跟谁对比
把两个基因组序列,贴到BLAST里面就可以了
下什么,免费的文章直接下就行,收费的要交美元很贵.genebank免费,可下载序列.最好找个用的熟的人给你演示一遍.
在NCBI中需要选核算那个选项,然后写出微生物英文缩写名称,另外最好写上该基因片段名称.点击搜索即可.会搜到很多基因,找几个典型的基因,然后复制到txt文档里,用DNAStar的editseq来查询已