怎样查某一生物的mRNA序列
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/28 18:31:27
只有mrna的情况下不借助基因库事找不到的
CDS(codingsequence)序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列.在NCBINucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列在出现的结果中,有CDS这一项,底下的核酸序列就是该
C.mRNA的合成是由DNA上的碱基决定的,遵循碱基互补配对
1NCBIORFfinder2NCBIBlast3看看该SNP所改变的密码子是否和原来的密码子编码同一个氨基酸(从ATG开始,3n)
mRNA是以DNA分子的一条链为模板转录形成的,因此其核苷酸序列与DNA分子的一条链的核苷酸序列互补.故选:B.
然后选择unigene,搜索没什么好详细的了阿进去那个NCBI的网址,下拉菜单选择unigene,或者gene,nucleotide都可以,然后搜索sod或者superoxidedismutase
totalRNA反转录,纯化mRNA,如果知道该序列,用引物调出来后,连到克隆载体,一般T载就可以,亚克隆.双酶切转到连到表达质粒载体上,如果只看表达与否,可以连一个标记基因,如GFP或者lux发光基
找到一个物种的mRNA序列,用mRNA的序列去进行blast,找同源性高的序列,找不同物种的.就可以了
NCBI上一般不会有说明,你需要近其他预测信号肽的网站进行分析比如:
CDS有点不太明白你的意思,你找到的是不是基因组的序列啊?如果找到了mRNA的序列,其他的都比较好找了.genomicsequence后面的序列号是基因组的,GeneID后面才是该基因的序列,如果你是
简单点说-35(RNA聚合酶结合位点).-10(RNA荣合酶起始位点)启动子序列和终止子;复杂点,我给你提供一段内容(留意参考资料,那里有不少答案哈)包括启动、延伸和终止.启动RNA聚合酶正确识别DN
我觉得D不对.因为eIF只真核生物有.而Shine-Dalgarno序列只在原核生物里都有(eifstandsforEukaryoticinitiationfactor,right?)
用该mRNA做模板反转录出cDNA将cDNA导入大肠杆菌中然后应用中心法则DNA转录出新mRNA新mRna翻译出蛋白质
不好说,实际上原核生物mRNA上可能就在第一个顺反子(基因)上有SD序列,而后续顺反子没有,核糖体翻译完第一个顺反子后,发生解体,但是小亚基仍然在mRNA上滑行,如果下一个顺反子距离不远,则小亚基有很
最简单的办法:用BLAST工具你不知是到蛋白质序列,在NCBI用该蛋白质序列在BLAST数据库,进行blast,可以找出基因序列.或将之转换为cDNA序列.用cDNA去BLAST都能找到你所想要的基因
根据mRNA(真核的)设计的引物,一般如果用DNA做模板的话,那么会出现的情况会是以下几种.一是能扩增出条带,但目标条带比你要的条带要大,因为你会连同内含子一同扩增出来,所以片段会偏大.二是什么都扩增
一般的引物序列是需要根据你所做的目的基因序列来自行设计的,你所述“F984和R1378”是否是16srRNA上的,通常使用的16srRNA上的引物有以下一些,请参阅:•27f5'AGAG
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/进入NCBI,在AllDatabases下输入所要查的基因名称,例如NADPH,点search,会跳出很多信息,点击Nucleotide进入后会
和它的DNA序列比对
如果你在NCBI查到一个基因,在summary栏目的下面紧接着就是一个叫做“Genomicregions,transcripts,andproducts”的栏目,是一个图,左侧有蓝色的小字“NM_……