琼脂糖凝胶电泳没有跑出条带是怎么回事
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:综合作业 时间:2024/05/14 04:29:17
琼脂糖凝胶电泳没有跑出条带是怎么回事
用1%的琼脂糖凝胶,70V左右的电压下电泳,肉眼可以看到DNA样和Marker的蓝色跑到了3分之2处,但在紫外灯下只有Marker跑出了条带,但不明显,DNA样完全没跑,只在孔的地方有荧光
用1%的琼脂糖凝胶,70V左右的电压下电泳,肉眼可以看到DNA样和Marker的蓝色跑到了3分之2处,但在紫外灯下只有Marker跑出了条带,但不明显,DNA样完全没跑,只在孔的地方有荧光
原因很简单.样品里的目的片段DNA量太少,所以没有检测到.
再问: 是这个原因吗?点样的孔那里是有荧光的
再答: 具体是什么样品?加样孔周围的荧光可能是基因组DNA。
再问: cDNA用PCR扩出来的DNA
再答: 那就是PCR没做出来,加样孔周围是基因组DNA。
再问: PCR变性退火什么的条件和之前一样扩出来过,这次加样量跟之前不同,没扩出来是这个原因吗
再答: 我只是根据电泳结果判断你的PCR失败,但是PCR失败的原因可能有很多,加样量只是其中之一。
再问: 那什么条件做电泳跑出的条带会很明显啊
再答: 你的问题并不是琼脂糖电泳没跑好。
再问: 我知道 但是我之前扩出了PCR电泳跑得也不是很好 之前出现的情况是marker条带都很清楚 但是DNA条带很模糊 荧光也很浅 当时用的是0.8%的琼脂糖 想知道怎么能让条带更清晰
再答: 只要marker很清楚,DNA胶本身就没问题。你的PCR产物不清楚,一是上样量不够,二是DNA样品可能有降解,不要反复冻融。
再问: 我的DNA样每次都是现用cDNA扩出来的 有可能是cDNA降解了吗?一般的上样量就是5,6微升吧?
再答: 上样量不是固定的,你可以根据自己的情况加多加少。 至于PCR,要不你换个Taq酶试试,可以用TAKARA的ExTaq试试。
再问: 是这个原因吗?点样的孔那里是有荧光的
再答: 具体是什么样品?加样孔周围的荧光可能是基因组DNA。
再问: cDNA用PCR扩出来的DNA
再答: 那就是PCR没做出来,加样孔周围是基因组DNA。
再问: PCR变性退火什么的条件和之前一样扩出来过,这次加样量跟之前不同,没扩出来是这个原因吗
再答: 我只是根据电泳结果判断你的PCR失败,但是PCR失败的原因可能有很多,加样量只是其中之一。
再问: 那什么条件做电泳跑出的条带会很明显啊
再答: 你的问题并不是琼脂糖电泳没跑好。
再问: 我知道 但是我之前扩出了PCR电泳跑得也不是很好 之前出现的情况是marker条带都很清楚 但是DNA条带很模糊 荧光也很浅 当时用的是0.8%的琼脂糖 想知道怎么能让条带更清晰
再答: 只要marker很清楚,DNA胶本身就没问题。你的PCR产物不清楚,一是上样量不够,二是DNA样品可能有降解,不要反复冻融。
再问: 我的DNA样每次都是现用cDNA扩出来的 有可能是cDNA降解了吗?一般的上样量就是5,6微升吧?
再答: 上样量不是固定的,你可以根据自己的情况加多加少。 至于PCR,要不你换个Taq酶试试,可以用TAKARA的ExTaq试试。
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