跨膜蛋白哪部分抗原性强? 预测的B细胞表位位于胞质,怎么办?
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:生物作业 时间:2024/05/16 10:05:19
跨膜蛋白哪部分抗原性强? 预测的B细胞表位位于胞质,怎么办?
跨膜蛋白能够和外界配体结合的最合适位置只能是在胞外啊.预测到在胞质内貌似没太大的价值.可能根据预测,胞内部分的抗原性强,但是没有办法实际去应用啊.
楼主是用某种特异性的抗体去预测的吗?如果真要找的话就用胞质外的那部分肽链中可能有口袋状或者突出状结构的位置进行一下预测.
再问: 谢谢,很有帮助。我使用DNAStar预测的,我希望合成蛋白或肽链免疫动物,我在胞外只找到一段较为合适,含8个氨基酸,用它免疫动物可以获得特异性抗体吗?一般肽链多长效果好呢?另外为什么我预测的抗原表位在PUBMED检索显示位于胞内,可是Santa Cruze公司却有相应的抗体呢?
再答: 免疫动物获得抗体这块我真不是很了解,是否8个氨基酸够长,如何免疫等。我真的不知道。所以为了不误导你,我就不瞎猜了。这个问题我建议你去生物谷或者生物秀或者丁香园上的论坛上找找答案。 有相应抗体的情况并不是不可能,还记得类风湿型关节炎的发病机理吗?就是因为攻击病原体的时候,识别了自身细胞的表面抗体。这概率都有可能发生。预测到相对应的抗原决定簇我觉得也是有可能的,它可能是来自于另外一个蛋白的相应识别位点。 另外计算机的预测不可全信...... PS:只能帮你到这么多了~~
楼主是用某种特异性的抗体去预测的吗?如果真要找的话就用胞质外的那部分肽链中可能有口袋状或者突出状结构的位置进行一下预测.
再问: 谢谢,很有帮助。我使用DNAStar预测的,我希望合成蛋白或肽链免疫动物,我在胞外只找到一段较为合适,含8个氨基酸,用它免疫动物可以获得特异性抗体吗?一般肽链多长效果好呢?另外为什么我预测的抗原表位在PUBMED检索显示位于胞内,可是Santa Cruze公司却有相应的抗体呢?
再答: 免疫动物获得抗体这块我真不是很了解,是否8个氨基酸够长,如何免疫等。我真的不知道。所以为了不误导你,我就不瞎猜了。这个问题我建议你去生物谷或者生物秀或者丁香园上的论坛上找找答案。 有相应抗体的情况并不是不可能,还记得类风湿型关节炎的发病机理吗?就是因为攻击病原体的时候,识别了自身细胞的表面抗体。这概率都有可能发生。预测到相对应的抗原决定簇我觉得也是有可能的,它可能是来自于另外一个蛋白的相应识别位点。 另外计算机的预测不可全信...... PS:只能帮你到这么多了~~
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