如何判断某段DNA 序列中可能存在转座子（插入序列 IS）?

来源：学生作业帮编辑：作业帮分类：生物作业时间：2024/05/16 15:45:47

如何判断某段DNA 序列中可能存在转座子（插入序列 IS）?
如何设计实验通过比较是否发生移位呢?请高手支招.

一般的方法是针对这段DNA序列设计引物,进行PCR,比较产物的序列长度,如果差异太小的话可能就需要PCR以后进行测序了.楼上说的探针杂交法也可以,但是针对一个位置可以,多了的话很贵,而且探针也不一定能够识别所有的可能出现插入的位点.
具体实验中对于什么样的位置设计引物之类的都还是有不少要摸索的地方.
再问：谢谢你的回答，这个不是实验中的问题。。。我想要理论点的答案，比如探针杂交的话如何判断移位发生了呢？
再答：探针的原理是这样，根据原有的DNA序列设计一段与之互补的短的核苷酸链，上面带有荧光标记，如果能够结合，就会发光。如果不能结合，就没有荧光，这样就可以判断是否有缺失或者插入，如果是移位的话，需要有一点先验的知识，比如知道哪一段可能会移位，然后针对这一段和原来的正确的链连接的部位设计探针。如果没有先验知识的位移，一般用PCR的方法，如果移位的话，片段大小会发生变化。产物的判断也比较容易。其次，最方便无脑的方式就是测序了哈哈

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