NCBI使用问题最近在做里氏木霉的纤维素酶(Trichoderma reesei cellulase)基因,遇到一个问题
来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:语文作业 时间:2024/05/11 13:55:00
NCBI使用问题
最近在做里氏木霉的纤维素酶(Trichoderma reesei cellulase)基因,遇到一个问题,做PCR需要引物,在NCBI上查酶基因序列时出来100多条,以前没用过NCBI,不知道应该用哪一个,请知道的生物学界达人教教我,
最近在做里氏木霉的纤维素酶(Trichoderma reesei cellulase)基因,遇到一个问题,做PCR需要引物,在NCBI上查酶基因序列时出来100多条,以前没用过NCBI,不知道应该用哪一个,请知道的生物学界达人教教我,
里氏木霉的纤维素酶有很多种,其中内切酶就有很多种,比如糖苷酶12家族的酶切酶III:The X-ray crystal structure of the Trichoderma reesei family 12 endoglucanase 3.
还有若干种外切酶.
在NCBI上搜的时候Search选项选择PubMed,然后可以以Trichoderma reesei cellulase为关键词搜索,或者根据你要找的酶的种类和名字,比如是内切酶还是外切酶?被编为几号?这些都可以作为关键词来帮助你搜索.
然后找到你想要的酶的基因序列就可以了,不过设计引物的时候注意哪边是5'端.NCBI上给出的序列有些是基因的反补序列,需要用序列处理工具取反补,这样得到的才是基因序列.
还有若干种外切酶.
在NCBI上搜的时候Search选项选择PubMed,然后可以以Trichoderma reesei cellulase为关键词搜索,或者根据你要找的酶的种类和名字,比如是内切酶还是外切酶?被编为几号?这些都可以作为关键词来帮助你搜索.
然后找到你想要的酶的基因序列就可以了,不过设计引物的时候注意哪边是5'端.NCBI上给出的序列有些是基因的反补序列,需要用序列处理工具取反补,这样得到的才是基因序列.
里氏木霉的纤维素酶基因可以转化到产蛋白酶的枯草芽孢杆菌基因组上吗?
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NCBI使用问题.我是初学者,想知道用NCBI怎么查dna、rna的全部序列啊?
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