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基因序列的方向?基因序列的方向是3‘-5’吗?那如果在基因组中,两个基因序列方向不同,是不是意味着RNA聚合酶要去调整方

来源:学生作业帮 编辑:作业帮 分类:生物作业 时间:2024/05/15 07:19:23
基因序列的方向?
基因序列的方向是3‘-5’吗?那如果在基因组中,两个基因序列方向不同,是不是意味着RNA聚合酶要去调整方向来使得基因方向相反的目的基因得以表达?还是说要更换模版?DNA的两条链中有一条是模板链,但是不是说两条链中任何一条链,任何时候都不绝对是模板链,而要看某个基因了,那个基因在那条链上,就以那条链做模板,基因在另一条互补链上,表达的时候就要更换模板,
既然已经有了推荐答案,
首先,楼主的问题没有那么混乱的,不要紧张.补充瑜玥的回答:两个基因的编码框有重叠是存在的,无论是同链重叠还是异链重叠.而且个人认为从基因组的大小和进化的角度来看,这也应该是可以存在的.这个在pubmed上可以找到不少文献,不具体说了,给篇综述(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18410680)
其次,针对楼主的追问.箭头指代的确实是基因的读取方向.我想楼主不太清楚的地方应该是DNA双链是反向平行的;而RNA的转录合成由于RNA聚合酶的特性,是从3‘到5’端读取DNA,合成的RNA是从5‘到3’.所以说楼主提到的方向问题(3‘-5’)没有错,只不过DNA双链反向平行的特性决定了转录RNA的方向有可能不同向.
所以楼主说的“DNA的两条链中有一条是模板链,但是不是说两条链中任何一条链,任何时候都不绝对是模板链,而要看某个基因了,那个基因在那条链上,就以那条链做模板,基因在另一条互补链上,表达的时候就要更换模板”是对的.但其实不存在更换模板的问题,转录开始时RNA聚合酶结合到DNA上的时候方向就选定了(当然这一点好像最近有一些新的进展争议,我的说法不一定严格,但意思应该还是对的),所以不要想像有个什么跳跃更换的过程,两条链是平等的,就是一个选择问题,不存在转录到一半跳到另一条链上之类的事情.
我就不用楼主的“基因序列的方向”这种说法了,既然两条DNA链是反向平行的,那么选择不同的链,转录合成RNA的前进方向也就不同,所以需要用箭头表示出来.在用NCBI、UCSC等基因组浏览器时,在看基因的时候,你也是可以看到箭头的,方向有可能相同,也有可能不同.
回到楼主的pBR22这个质粒,楼主在网上看到解释是对的,只不过个人不太喜欢它的用词.其实基因无所谓在那条链上,实际研究中常用的是“转录方向”,我会说启动子的转录方向和抗性基因的转录方向相反.所以这样看来楼主追问中提到的两种说法表达的意思是一致的.