设引物序列时用ORF序列可以吗-搜答案-智慧作业帮

从NCBI中下载基因的序列,再用DNASTAR进行比对,那是保守区域!

你去找各大公司的产品手册,上面会有非常详细的随机引物的序列,随机引物非常的多,有上百种

用primerblast,输进去上下游,选好种属和扩增对象search不就出来了

1.登陆NCBI网站2.在上排找到BLAST,点击进入,我只用过Oldblast,你可以点击Oldblast的连接进入.3.找到Searchforshort,nearlyexactmatches,点击

理论应该用CDNA进行因为设计,但要保证你提取的mRNA的质量,尽量减少降解.可以在原序列基础上先写出互补序列再进行引物设计.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/194473617?report=genbank

FPrimer:5'-TTGTAAAAAAATTAAATTAA-3'RPrimer:5'-CATATTTTAATTAATATTTC-3'你这个序列AT含量太高,尤其是5'端A有7个连续重复,引物本身很

这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.

试试primer软件.

我也做得RT-PCR,是提取某物种中未测序的一段基因.是用近缘物种基因进行比对,得到保守序列设计引物,再提取总RNA,RT-PCR得到目的基因的片段再问：我需要检测的分子，在nucleotide里找不

NCBI的ORFFinderhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html

一般的引物序列是需要根据你所做的目的基因序列来自行设计的,你所述“F984和R1378”是否是16srRNA上的,通常使用的16srRNA上的引物有以下一些,请参阅：•27f5'AGAG

不是再答：对拓扑异构、长度、碱基比例排列、端处有要求。

直接设计只要包含了整个CDS区就可以再问：哦，那CDS和ORF是一样的吗，怎么查找基因的CDS区啊再答：恩差不多回事ORF是DNA上的CDS是mRNA上的看你模板用的是基因组DNA还是cDNA了反正就

如果设计在内含子序列中,RT-PCR检测到的可能是未被剪切的preRNA或RNA中污染的核DNA,如果设计在外显子序列中,RT-PCR检测到的可能是成熟mRNA,未被剪切的preRNA或RNA中污染的

不用太纠结,有点儿具体也是可以的,一般都能P出来.再问：很多mRNA选择设计不同长度的引物，没有一对是无found显示的，真的很让人纠结；请问文献上的引物有的也是这样吗，不完美，但能扩出来，不会影响q

引物有一条和模版的序列相同,而另一条和模版的序列反向互补,上游和下游是自己定的,分别位于模版的两端

这个问题很简单,扩增序列应该称为目的基因,目的基因一般都上万bp,从两头开始当然不合适.PCR扩增只能扩增出上下游引物之间的序列,因为只有引物之间的DNA双链是解链状态的.你的问题说明你对基础知识掌握

这个比较麻烦,如果你想用RACE的方法,3'末端需要添加上像真核生物那样的polyA尾巴,而且你要克隆它的全基因序列,还要做5'RACE.RACE技术比较适合真核生物.如果你要克隆的基