作业帮NCBI里面blast数据中query coverage
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/13 03:46:45
ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection（nr/nt）选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问：这一
带引号的都是一些数据库中的编号最前面几行是基因的名称染色体位点以及相关的文献的一些信息
1）输入fasta格式序列2）选择核算比对
什么跟什么说的太不清楚饿了只要你需要的那段序列是对的不就行了嘛跟引物序列有啥关系毕竟大部分的PCR引物设计都是在需要的序列两端隔一段距离而且如果你测序是拿PCR引物测的话那前面的几十个碱基都是测不准的
对序列匹配程度进行评分后得出的分值
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考：http://liucheng.name/475/
不能,要用多序列比较程序,如clustalw.
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考：http://liucheng.name/475/关于Blast的文章:http://liucheng.name/tag/blast/
生物信息学中的blast有两层含义:一方面,它是指一种快速的局域序列对位排列算法,在这方面与FASTA齐名；另一方面,它是指实现这个算法的软件.这个软件是由NCBI编写的（HTTP://www.ncb
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据
先到：选择Nucleotide-nucleotideBLAST(blastn)然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点BLAST!然后按Format!这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个
看性质可以翻译一下在看嘛
PLN是一个缩写词,代表plant,fungal,andalgalsequences,这个词代表GenBank18个子库中的一个.不同的物种序列此处的值会有所不同.18个子库的缩写和全称如下.事实上如
NCBI对Blast的原理和结果有专业的说明http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/Altschul-1.html
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
也就是说你的样品序列和网上序列的比对率,小于40bp重合就是黑色,50-80是绿色,大于200bp就是红色,
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中
在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18记作3.2E18,即E=Exponent,指数；幂再问：5e-04，即表示5×10^-4。谢谢再答：嗯，对的！
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多