blast结果中Query cover什么意思
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/17 17:20:46
带引号的都是一些数据库中的编号最前面几行是基因的名称染色体位点以及相关的文献的一些信息
对序列匹配程度进行评分后得出的分值
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考:http://liucheng.name/475/
NCBI在线Blast的图文说明本文详细出处参考:http://liucheng.name/475/关于Blast的文章:http://liucheng.name/tag/blast/
生物信息学中的blast有两层含义:一方面,它是指一种快速的局域序列对位排列算法,在这方面与FASTA齐名;另一方面,它是指实现这个算法的软件.这个软件是由NCBI编写的(HTTP://www.ncb
BLAST是用来比对序列的相似度的.
n.爆炸;巨响;一阵(强风);严厉的批评;愉快的经历v.爆破;摧毁;发出巨响;用力撞击;批评
直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问:我只是在做我的本科生毕业论文,所以不咋看得懂,我现在主要就是结果那块看不懂,不知道怎么分
先到:选择Nucleotide-nucleotideBLAST(blastn)然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点BLAST!然后按Format!这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个
恐怖组织声称对这次爆炸负责claim声称
flingingopenthedoor=flingingthedooropenopen为形容词,作补足语一股水流冲向房屋,把门冲开了.
NCBI对Blast的原理和结果有专业的说明http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/tutorial/Altschul-1.html
+号表示的是相似性质的氨基酸残基.
没事,这个可以,你应该是把设计的上下游引物都进行了比对,前两个比对结果应该就是上游、和下游引物,假设你第一个结果是上游,第二个结果是下游.那么第三个结果也就是下游比对结果,下游结合的位置距离上游、下游
Tm值太高了.只是逆转录的话,只要能逆转录出来,再用pcr扩就好了,特异性不用太讲究.
对上面这个页面进行一下必要的介绍:BLAST的这个页面主体部分(左面)包括了三部分:BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂
1.首先把测序后的序列和你目的基因的序列都拿到2.到这个网页http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多
你确定是两个不同的基因吗?会不会是同一基因的不同的可变剪切类型再问:是根据模式生物的不同基因的片段对得到的转录组进行blast查找,结果显示找到的是同样的序列。再答:或者就是你的那两个的基因不完整,可
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