作业帮如何利用NCBI 查找内含子和外显子 引物设计
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/16 00:52:30
在NCBI主页输入要查找的miRNA的名称,alldatabase中选择GENE；在搜索结果中选择目的miRNA,在NCBIreferencesequences（RefSeq）栏中点击目的miRNA的
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC（google之）,和基因组相关的这个网站做的不错
1、打开NCBI的主页2、在Search后面的第一个框内选择Nucledite3、在第二个框内输入你所要寻找的菌株名称4、点击Go5、在结果中过滤你需要的基因6、打开该搜索结果即可在最底部看到基因序列
ncbi上面有那个具体的网页很容易找的你确定改片段的名称以及物种就可以
要确定一个ORF,我个人觉得需要确定上游是否有可能的启动子序列先分析启动子可能位置,再确定ORF.你可以把你克隆的片段上游2k以内的序列,用一些启动子分析软件找下,分析下可能的转录起始位点,再在下游找
左边的下拉菜单选择gene中间的搜索关键词输入muscox3点击search,在一系列结果中选择含有关键词的那个链接(若多个都含有,那就选尽量靠前的）
首先选择Gene的标签,输入基因名,然后点击搜索,然后出来一大堆基因,选择你的那个物种的基因,点击,进去看一下,选择Mapviewer然后找到序列,选择基因的外显子上游2000bp,下载...
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置
据我所知ncbi没有相关的功能,毕竟其是以核苷酸序列为主.因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性,你可以到swissprot网站,那里有许多相关的服务.例如,计算PI你可以用ComputepI/Mwto
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
输入该激酶的名字查询蛋白质,就有相应的序列信息.
就查那个基因在下面有详细的描述包括哪哪是外显子再问：有没有什么详细的步骤啊，有点点看不懂那个网站。再答：NCBI首页搜然后点necleotide旁边那个数字然后找到那个基因然后下面各种描述exon后面
现到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene然后输入ABL[sym],代表你是在查找ABL为缩写符号的基因就会得到http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gen
用CTRL+F查找
先查找你所需要的基因,然后根据相关信息查找这个基因出自的文献,看文献内容了解这个基因的具体功能.
直接用关键词Homosapiensmitochondrion在genome数据库中搜索就行了.找completegenome这是找到的.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/site
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
基因的全序列是么?OK进入NCBI,选中mapview选择项.http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/输入你要下载的基因名称和物种.举个例子,我要下载小鼠的IGF2基因
GT-AG规则存在着一定的变异.近缘基因组中的同源基因一般有保守的intron/exon结构,可以帮助鉴定内含子和外显子的边界.
ncbiblast中的protein