27f 1492r引物序列

一般未知的序列旁边都有已知的一段吧,就是你说的“修饰片段”?PCR这种flankingsequence可以有很多方法,比如TAIL-PCR,用ADprimer（简并引物）和特异性引物就可以得到目标片段

你先设计几条引物,然后上NCBI数据库BLAST一下（在外显子上设计比较好些）再问：我的想法是先将已知的序列与同源物种比对，以同源物种多出的区域设计上下游引物，可是这样得到的引物分值太低，怎么办再答：

你去找各大公司的产品手册,上面会有非常详细的随机引物的序列,随机引物非常的多,有上百种

用primerblast,输进去上下游,选好种属和扩增对象search不就出来了

1.登陆NCBI网站2.在上排找到BLAST,点击进入,我只用过Oldblast,你可以点击Oldblast的连接进入.3.找到Searchforshort,nearlyexactmatches,点击

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/194473617?report=genbank

FPrimer:5'-TTGTAAAAAAATTAAATTAA-3'RPrimer:5'-CATATTTTAATTAATATTTC-3'你这个序列AT含量太高,尤其是5'端A有7个连续重复,引物本身很

上游：5ggaattcatgtttagtttgaaaaaaac3下游：5gggttcgaattagacattgccaacatatt3你要的并不是鉴定引物,而是扩增引物根本不用软件

这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.

可以找一下原始文献,或到ncbi里搜索一下.另外ncbi里有个premer-blast可以试一下.---中国西部生命科学论坛再问：primerblast主要进行序列比对，NCBI没有查询到。

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.

试试primer软件.

基因bank里面有~

我也做得RT-PCR,是提取某物种中未测序的一段基因.是用近缘物种基因进行比对,得到保守序列设计引物,再提取总RNA,RT-PCR得到目的基因的片段再问：我需要检测的分子，在nucleotide里找不

对于这种情况,如果你只是找不到扩增引物的序列,但是能找到后面所要扩增的序列的话,那么可能还是因为测序引物离你的扩增片断太近.如果不是这种情况,那么可能是你根本没有将扩增片断成功连入当然还有一种可能是公

正规生物公司合成引物不是应该提供序列的吗,而且一般都是自己设计引物序列交给生物公司帮你合成啊,怎么会没序列呢,要是你知道货号可以直接联系合成的公司询问呀

一般对于已知序列的PCR当然不要从保守序列来设计引物,只要从开放可读框前后开始设计就行了.需要从保守序列设计引物的情况一般是两种,一是某个物种里面某个特定基因序列从未被分离过,但其进化关系相近的物种有

对上面这个页面进行一下必要的介绍：BLAST的这个页面主体部分（左面）包括了三部分：BLASTAssembledGenomes、BasicBLAST、SpecializedBLAST.相信大家可以看懂

根据cDNA序列设计就行了,不用加3‘utr,你做载体构建还是tr-pcr基因检测?再问：做rt-pcr检测。我们老板说要加上3‘utr的序列，不知道为什么？再答：不用加，我做rt-pcr检测那么多了

我有一个关于primer5的使用技巧的文档,你需要的话可以给你,里面介绍很详细,其实引物设计都是很简单的,自己多试试就很简单了